樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,，在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟,。在理想狀況下,，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,，您還有必要了解各類(lèi)細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,，以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間,，它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊,。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,，有些細(xì)胞更加粘稠,，形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差,。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。上海single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

作為單細(xì)胞測(cè)序的又一個(gè)重要里程碑,，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀器,、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件，能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀,，因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記,、測(cè)序和分析，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況,，并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析,，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜,。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類(lèi)型,、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。single cell RNA單細(xì)胞烈冰科技成立10余年,，為科研學(xué)者提供專(zhuān)注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量,，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求,，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,，存在各種情況的序列污染,。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征,，即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例,。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,，為后續(xù)細(xì)胞類(lèi)型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),。

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)，為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),，保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性：BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,，可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制，如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率（雙細(xì)胞率）,。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量，并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ,；在細(xì)胞裂解前的步驟中評(píng)估細(xì)胞活性,；并對(duì)通過(guò)測(cè)序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息,，在進(jìn)行高成本的下游測(cè)序之前,，用戶(hù)可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問(wèn)題。這些指標(biāo)允許用戶(hù)對(duì)不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤,。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),，助力您的深入科學(xué)探究。

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行,，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,，通過(guò)降維（pca）,，無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù),，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí),，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真,。這也是很多文章,，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿(mǎn)足分析和文章發(fā)表的多重需求,。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,，只要您需要，烈冰提供全流程的無(wú)憂(yōu)服務(wù),。珠海BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

附加流式分選細(xì)胞表面Marker,，對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測(cè)序項(xiàng)目,。上海single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),，可平行分析成千上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞內(nèi)數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)水平，單細(xì)胞RNA-seq正在改變我們對(duì)細(xì)胞的理解,。而烈冰作為多平臺(tái)的技術(shù)服務(wù)提供商,，基于BD 在生物學(xué)領(lǐng)域40年的專(zhuān)業(yè)技術(shù)，滿(mǎn)足您的實(shí)驗(yàn)需求,，在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能,。BD單細(xì)胞測(cè)序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性，如微陣列和大量細(xì)胞RNA-seq,，這些技術(shù)檢測(cè)通過(guò)實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,，依賴(lài)于對(duì)多個(gè)細(xì)胞的平行檢測(cè)。用戶(hù)可以鑒定和表征新型和罕見(jiàn)細(xì)胞類(lèi)型,，其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到疾病發(fā)展的多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過(guò)程,。上海single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

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