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重慶BD Rhapsody單細(xì)胞平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-07-14

Single Cell Sequencing技術(shù),,即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況,。那么問題來了,,如何獲得單個細(xì)胞?如果無法獲得單個細(xì)胞這一切都是不成立的,;如何獲得大批量的單個細(xì)胞,?單個組織細(xì)胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足,;如何低成本地獲得大批量單個細(xì)胞,?單細(xì)胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細(xì)胞的時候,,如果單個細(xì)胞的分選成本也很高,,技術(shù)根本無法普及。所以,,正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測序在單個細(xì)胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足,,直到幾個單細(xì)胞測序突破性技術(shù)的誕生。深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代,。重慶BD Rhapsody單細(xì)胞平臺

烈冰生物BD Rhapsody平臺,,采用精簡的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功: 1.制備單細(xì)胞懸液:可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液;系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計,,無需擔(dān)心通道堵寨,;通過重力輕輕沉淀細(xì)胞,可捕獲脆弱細(xì)胞,,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區(qū),,可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描:估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細(xì)胞和磁珠的微孔數(shù)量;測定細(xì)胞存留率,,評估是否發(fā)生細(xì)胞損失 (5)細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液,,確保細(xì)胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況武漢single cell 單細(xì)胞多組學(xué)測序BD平臺基于cyto-seq技術(shù),,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞和磁珠的一對一結(jié)合,。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細(xì)胞進(jìn)行清洗和計數(shù)后,,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),,因?yàn)檫@可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間,,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,,它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險,,而且每個團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù),又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快,。對于這些細(xì)胞,,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。

您的珍貴樣本,,還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),,BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對細(xì)胞的捕獲沒有偏好性,,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,,由于單個微孔板中容納了22萬+個微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個樣本捕獲3000-5000,,至高達(dá)10000個細(xì)胞,,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無限稀釋過程,,但22萬+微孔的存在,,也對大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個細(xì)胞的捕獲(單個微孔板),,滿足您的多重需求,。單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。

從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。測序的革新讓科學(xué)研究從個體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個體細(xì)胞的基因差異,。西安BD VDJ單細(xì)胞多組學(xué)測序

搭配BD FACSMelody流式分選儀,,全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺。重慶BD Rhapsody單細(xì)胞平臺

烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù),,為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),,保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制,,如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率(雙細(xì)胞率),。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量,并確認(rèn)微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ,;在細(xì)胞裂解前的步驟中評估細(xì)胞活性,;并對通過測序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息,,在進(jìn)行高成本的下游測序之前,,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤,。重慶BD Rhapsody單細(xì)胞平臺

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