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濟南scRNA單細胞服務(wù)機構(gòu)

來源: 發(fā)布時間:2022-07-16

作為單細胞測序的又一個重要里程碑,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器,、試劑盒和基礎(chǔ)信息學(xué)軟件,,能精確對接illumina測序儀,因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記,、測序和分析,,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復(fù)雜細胞群體進行深入細致分析,,繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜,。 以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,并逐個鑒定細胞類型,、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷,。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系,。對于消化背景雜,,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細胞的項目,,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺,。濟南scRNA單細胞服務(wù)機構(gòu)

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統(tǒng),,基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù),、生物學(xué),、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果,,而磁珠的拆分使用和即時存儲,,可增加實驗設(shè)計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,,從細胞鋪板前微孔板空板檢測,,到細胞上樣、磁珠上樣,、磁珠洗滌掃描,、細胞裂解,、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,,均實現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。scRNA單細胞數(shù)據(jù)分析深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代,。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,,單細胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,,一旦制備好樣本,,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,,您還有必要了解各類細胞的不同性質(zhì),,因為這可能會影響細胞應(yīng)在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用,。例如,,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊,。這些團塊很難解離,,增加了堵塞的風(fēng)險,而且每個團塊被當(dāng)成單細胞計數(shù),,又降低了細胞計數(shù)的準確性,。此外,有些細胞更加粘稠,,形成團塊的速度更快,。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差,。

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快,、精,、準:一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型,;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖,、Heatmap,、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率,。烈冰一站式單細胞測序服務(wù):立足科學(xué)研究,解碼生命本質(zhì),。

單細胞獲得困難,,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,,100+組織類型解離protocol,,精心設(shè)計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,,確保單細胞的獲得,。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用,? 烈冰采用國際認可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細胞過濾技術(shù),,確保凍存組織使用。 珍貴樣本,,細胞數(shù)量太少,,消化背景雜無法做單細胞? 采用國際認可的10X Genomics,,BD Rhapsody雙平臺模式,,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞,。 單細胞RNA分類精度不足,,部分細胞無法細分? 烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),,真正做到從上游到下游的全流程檢測,,確保超高的細胞分類精度。烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_和自主研發(fā)國產(chǎn)化實驗平臺,。南京BD單細胞平臺

BD Rhapsody平臺在細胞捕獲過程中沒有偏好性,,可同樣無差別捕獲中性粒細胞。濟南scRNA單細胞服務(wù)機構(gòu)

根據(jù)烈冰多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗,,為什么不建議您一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,,而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個細胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細胞捕獲數(shù)過多時,,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù),,都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時,數(shù)據(jù)量在100G左右時,,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。濟南scRNA單細胞服務(wù)機構(gòu)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗),,從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機,、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè),。公司自創(chuàng)立以來,,投身于單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細胞多組學(xué)測序,,是醫(yī)藥健康的主力軍。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,,追求出色,,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,,以應(yīng)用為重點,,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,,提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求,,提高產(chǎn)品價值,,是我們前行的力量。