對于稀有樣本,,或細胞量比較少的稀有組織,,樣本中每一粒細胞都很珍貴,,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對該種類型的樣本能實現(xiàn)友好包容,,如果在實際實驗中,我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同,,容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況,。也會和您探討是否考慮去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物的操作,以獲得高質量數(shù)據(jù)是至關重要的,。這是因為,,死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲,,并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質量,。因此當樣本活性較差時,對細胞懸液中細胞活性檢測后,,需要進行一般死細胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時考慮此操作),,以保證較高的上機捕獲細胞的質量。測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異,。廣州單細胞平臺
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,,而是參與了相互關聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng),,這些合在一起實現(xiàn)了細胞,、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關重要,。”為了推動科學發(fā)現(xiàn),科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。陜西BD單細胞實驗平臺烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細胞測序服務,。
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結果,,深入挖掘其背后的生物學意義,;從操作便捷、結果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,,加速科研進程,!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),,不但可以將海量復雜的結果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,!
Single Cell Sequencing技術,即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(NGS,,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,,如何獲得單個細胞,?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細胞,?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,,如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細胞,?單細胞測序成本非常高,,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,如果單個細胞的分選成本也很高,,技術根本無法普及,。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,,直到幾個單細胞測序突破性技術的誕生,。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,烈冰配套全程個性化,、定制化地數(shù)據(jù)分析服務,。
對于單細胞測序而言,,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續(xù)各項分析,,并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,,而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,,但是單細胞測序,,特別是目的為圖譜研究時,需要通過提高樣本復雜度(增加樣本數(shù)),,盡可能的構建某一疾病類型,、群體細胞圖譜信息。因此,,單細胞測序實驗設計時首先需要保證生物學重復,,不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫,、測序,,以保證捕獲到足夠的細胞數(shù),單個樣本分別捕獲細胞時,,后續(xù)分析除了整體分析以外,,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準確性,。烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,,解碼生命本質。長沙BD單細胞轉錄組測序
烈冰專注單細胞多組學測序領域,。廣州單細胞平臺
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉錄組的變化,,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,單細胞懸液應當保存于冰上,,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟,。在理想狀況下,一旦制備好樣本,,應當在3min鐘內將其用于下游步驟,。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質,,因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,,而且每個團塊被當成單細胞計數(shù),,又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外,,有些細胞更加粘稠,,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,,必須盡量減少制備和使用之間的時間差,。廣州單細胞平臺
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