針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù),，為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好,？一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問(wèn)題,。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí),，如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,，上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加,，在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想（細(xì)胞活性<90%、碎片率>5%,、結(jié)團(tuán)率均>5%）的情況下,，引入的背景信號(hào)會(huì)增加，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell,、non-cell無(wú)法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低,。當(dāng)cell和non-cell無(wú)法有效區(qū)分時(shí)，會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果,！當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí),，多細(xì)胞率會(huì)增加，數(shù)據(jù)分析時(shí),，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢測(cè)數(shù)是正常cell的N倍（N是一個(gè)GEM包裹的細(xì)胞數(shù)）,，導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)（單個(gè)細(xì)胞基因檢測(cè)中位數(shù)、單個(gè)細(xì)胞UMI檢測(cè)中位數(shù)）虛高,。此部分“cell”雖然可以通過(guò)設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進(jìn)行過(guò)濾,，但是容易會(huì)有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測(cè)細(xì)胞的人為去除！助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息,；助力醫(yī)療健康時(shí)代,！杭州single cell RNA單細(xì)胞平臺(tái)

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中：以捕獲5000個(gè)細(xì)胞,、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),，每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,，例如成熟的B,，T，粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,，由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,，導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,，他們的基因表達(dá)數(shù)較高,，甚至可以超過(guò)1W，這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高,。因此,，我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí)，需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成,。北京single cell 單細(xì)胞測(cè)序烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表,。

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,，這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記、建庫(kù),、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會(huì)影響建庫(kù)的成功率,；計(jì)數(shù)偏低,，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過(guò)低,，就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中,，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,，其具有Prime Treat,、Cell Load、Bead Load,、Wash,、Lysis、Retrieval多種操作模式,，來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作,。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,，保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性,。

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表,；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot,；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型；一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,，還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析，節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率,。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細(xì)胞測(cè)序服務(wù),。

什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看,，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%）,，懸液中細(xì)胞大量死亡,，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài)，失真嚴(yán)重,，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到,，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,，因此希望您在提供樣本時(shí)，盡可能提供足量的細(xì)胞,，以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題,，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低，一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求,，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物,。個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面，滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求,。深圳單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司

高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次突破性的改變,，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定。杭州single cell RNA單細(xì)胞平臺(tái)

烈冰與國(guó)內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),，1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計(jì)）,，在單細(xì)胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,，總IF＞300+,，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity,、Nature Cell Biology,、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊,，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究,、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制，免疫研究,、腦神經(jīng),、白血病、胚胎發(fā)育,、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。杭州single cell RNA單細(xì)胞平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,，市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),，計(jì)算機(jī),、軟件及耗材（除專控）,，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司，是一家集研發(fā),、設(shè)計(jì),、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢，市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,，市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)），從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),，計(jì)算機(jī),、軟件及耗材（除專控）,，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一，為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,，追求出色，以技術(shù)為先導(dǎo),，以產(chǎn)品為平臺(tái),，以應(yīng)用為重點(diǎn)，以服務(wù)為保證,，不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,，提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場(chǎng),，以敏銳的市場(chǎng)洞察力,，實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。