單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,，不需要命令行操作,。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù),，UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息,；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量,、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示,，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況,?；诖胖锽arcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu)，精細(xì)區(qū)分上萬個(gè)細(xì)胞中mRNA的來源及表達(dá)豐度,。烈冰科技單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,，還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對(duì)傳染病,、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識(shí),。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài)，到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,，單細(xì)胞測(cè)序正在推動(dòng)突破性的研究,，有望改變生物學(xué)和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病，還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),，曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰,。隨著我們邁向科學(xué)的未來，我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),，而定義科學(xué)未來的知識(shí)新深度是十年前的人們所無法想象的,。上海烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)，助力您的深入科學(xué)探究,。

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備,，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色,，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無論具體的考慮因素如何,，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。

什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢,？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來看，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細(xì)胞大量死亡,，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),，失真嚴(yán)重，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。但需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時(shí),，盡可能提供足量的細(xì)胞,，以備實(shí)驗(yàn)過程中可能存在的細(xì)胞死亡的問題，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低,，一般提供10萬個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求,，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。BD Scanner,，是您實(shí)驗(yàn)過程的又一雙眼睛,，實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)，精細(xì)質(zhì)控,。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,，在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫制備步驟,。在理想狀況下，一旦制備好樣本,，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟,。然而，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),，因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,，以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間,，它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù)，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性,。此外,，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快,。對(duì)于這些細(xì)胞,，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細(xì)胞測(cè)序服務(wù),。廣州BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,，滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求。烈冰科技單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,，針對(duì)多種組織類型的樣本,，采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞,， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫測(cè)序,，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型,，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本,。烈冰科技單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

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