關(guān)于10X Genomics單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類(lèi)型和樣本制備 ：10X平臺(tái)在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、無(wú)細(xì)胞隨便,、極少的細(xì)胞團(tuán)塊,，且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外,，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10X Genomics平臺(tái)兼容,。一般來(lái)說(shuō),，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類(lèi)型而變化。每種組織類(lèi)型都是獨(dú)特的,，因此,，必須在開(kāi)始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),，累積10+物種,、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織,，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,，烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。烈冰專(zhuān)精單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域,。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

烈冰生物成立于2010年,，與時(shí)俱進(jìn)，堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****,。專(zhuān)注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專(zhuān)精領(lǐng)域，在上海,、北京,、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所,，并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷(xiāo),、運(yùn)營(yíng)中心。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****,，60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán),，轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序,，核測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái),。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶(hù)、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開(kāi)發(fā),、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,，疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案,，助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表，30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合（助力）發(fā)文,，IF 10+文章占比＞65%,。蘇州10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序全線搭建10x Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。

一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,，小心得不償失,，原因在這：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行,，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后,，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca）,，無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真,。這也是很多文章,，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了,。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。

RNA測(cè)序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法作為一類(lèi)強(qiáng)大的工具,，可提供混合樣本的基因表達(dá)平均數(shù)據(jù)，幫助科學(xué)家開(kāi)始揭示這種異質(zhì)性,。隨后,，技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細(xì)胞技術(shù)上達(dá)到新高度——使得科學(xué)家能夠定義細(xì)胞類(lèi)型特異的基因表達(dá)，從過(guò)去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動(dòng)其表達(dá)模式的細(xì)胞異質(zhì)性,。這讓研究人員能夠更詳細(xì)地表征組織異質(zhì)性,，鑒定稀有細(xì)胞類(lèi)型，并逐個(gè)細(xì)胞地仔細(xì)分析其分子機(jī)制,。當(dāng)獲得了對(duì)其研究的生物系統(tǒng)更為真實(shí)的圖譜后,，研究人員就有了更為堅(jiān)實(shí)可靠的知識(shí)基礎(chǔ),，并能在這個(gè)基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實(shí)驗(yàn)，以獲取更深入的可行動(dòng)見(jiàn)解,。烈冰科技已建立了多種國(guó)際和國(guó)內(nèi)主流的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái),。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是分隔單個(gè)細(xì)胞以在其中進(jìn)行微反應(yīng)的物理平臺(tái),。在這個(gè)空間,，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,，以便下游識(shí)別?，F(xiàn)有技術(shù)的另一個(gè)主要區(qū)別是如何添加索引，就像生成測(cè)序文庫(kù)所涉及的流程步驟一樣,。10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用動(dòng)態(tài)微流控技（Drop-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理）,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，其中一列縱向孔道輸入細(xì)胞,，凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會(huì)吸附在凝膠微珠上,，并通過(guò)微流控技術(shù)，將之輸入到第二縱向孔道,，即油相孔道中,。這時(shí)候，就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個(gè)油滴中會(huì)落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,，那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手,，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù)。測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異,、基因結(jié)構(gòu)變異,、篩選分子標(biāo)記（SNPs或SSR）等生命科學(xué)重要問(wèn)題。陜西10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異,。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

作為單細(xì)胞測(cè)序的一個(gè)重要里程碑,，10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution，此平臺(tái)整合了儀器,、試劑盒和信息學(xué)軟件,，能精確對(duì)接illumina測(cè)序儀，因此可實(shí)現(xiàn)大量大細(xì)胞的快速高效標(biāo)記,、測(cè)序和分析,，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜和差異情況，并通過(guò)對(duì)復(fù)雜細(xì)胞群體進(jìn)行深入細(xì)致分析，繪制大規(guī)模單細(xì)胞表達(dá)圖譜,。 以量化細(xì)胞內(nèi)的群體異質(zhì)性,，并逐個(gè)鑒定細(xì)胞類(lèi)型、細(xì)胞狀態(tài)和動(dòng)態(tài)細(xì)胞躍遷,。除了有望鑒定新的細(xì)胞亞型和稀有細(xì)胞群體,，單細(xì)胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序多組學(xué)測(cè)序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,，是一家生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢(xún),，市場(chǎng)營(yíng)銷(xiāo)策劃，市場(chǎng)信息咨詢(xún)與調(diào)查（不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)）,，從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),，計(jì)算機(jī)、軟件及耗材（除專(zhuān)控）,，軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,，經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的公司。烈冰生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,，為客戶(hù)提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,，追求出色,，以技術(shù)為先導(dǎo)，以產(chǎn)品為平臺(tái),，以應(yīng)用為重點(diǎn),，以服務(wù)為保證，不斷為客戶(hù)創(chuàng)造更高價(jià)值,，提供更優(yōu)服務(wù),。烈冰生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時(shí)代,，對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,，高度的專(zhuān)注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信,。