針對(duì)樣本活性的問(wèn)題,，10×Genomics官方建議當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時(shí)應(yīng)做去除死細(xì)胞操作,，但也需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,，10×Genomics和MiltenyiBiotec都沒(méi)有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作,。基于烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)經(jīng)驗(yàn),，建議當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液（小于30%）,，懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),，失真嚴(yán)重,，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),，烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。天津二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

關(guān)于10XGenomics單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備：10X平臺(tái)在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,，獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、無(wú)細(xì)胞隨便、極少的細(xì)胞團(tuán)塊,，且細(xì)胞活力高（＞70%）,；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10XGenomics平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō),，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類型而變化,。每種組織類型都是獨(dú)特的,，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),，累積10+物種、50+組織的消化protocol,，若您的樣本為組織,，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助,。成都二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異,。

FluidigmC1平臺(tái)作為應(yīng)用于單細(xì)胞測(cè)序（SingleCellRNASequencing）領(lǐng)域的商業(yè)化分選技術(shù)，基于富魯達(dá)（Fluidigm®）的微流控技術(shù),，大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞,，進(jìn)行各類的Single-Cell測(cè)序建庫(kù)。當(dāng)然,，通量還是比較小,。但不可否認(rèn)的是，現(xiàn)在很多非RNA類SingleCell測(cè)序,，仍然在采用這樣的技術(shù),，如SingleCellDNA-Seq，SingleCellATAC-Seq等,，都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫(kù),。所以可以說(shuō)，至少在10X和BD,，或者其他企業(yè)推出有效的SingleDNA測(cè)序技術(shù)之前,，C1仍然會(huì)是市場(chǎng)上的重要組成部分。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞,。以10×Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMICounts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn),；否則,，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù),。烈冰單細(xì)胞測(cè)序,，助力您的深入科學(xué)探究。

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí),，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理,，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷,、結(jié)果可視化、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,，加速科研進(jìn)程！過(guò)去的十年,，我們是知識(shí)的承載者,；現(xiàn)在，我們?cè)谂?gòu)建醫(yī)學(xué)的大數(shù)據(jù)時(shí)代,；未來(lái)我們將重新定義知識(shí)形態(tài),！長(zhǎng)沙10X單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

烈冰引進(jìn)國(guó)際主流單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),，保障細(xì)胞精度的前提下提供組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息,。天津二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

單細(xì)胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定,？烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),，100+組織類型解離protocol，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離,、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,，確保單細(xì)胞的獲得。凍存樣本無(wú)法實(shí)驗(yàn),，珍貴樣本無(wú)法使用,？烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過(guò)濾技術(shù)，確保凍存組織使用,。珍貴樣本,，細(xì)胞數(shù)量太少,，消化背景雜無(wú)法做單細(xì)胞？采用國(guó)際認(rèn)可的10XGenomics,，BDRhapsody雙平臺(tái)模式,，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少，背景雜也能做單細(xì)胞,。單細(xì)胞RNA分類精度不足,，部分細(xì)胞無(wú)法細(xì)分？烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),，真正做到從上游到下游的全流程檢測(cè),，確保超高的細(xì)胞分類精度。天津二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,，交通便利,，環(huán)境優(yōu)美，是一家服務(wù)型企業(yè),。公司致力于為客戶提供安全,、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù)，是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè),。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,，致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求,，通過(guò)**技術(shù),，力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。