細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí),,需要在細(xì)胞清洗和過(guò)濾之后測(cè)定細(xì)胞活力,這一點(diǎn)至關(guān)重要,。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法,,烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性,,取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞,。一旦過(guò)濾和清洗完成,可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備(如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀)進(jìn)行定量,。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù),,還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序通過(guò)雙文庫(kù)構(gòu)建,,實(shí)現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡,。武漢二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間),。武漢二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)烈冰生物成立于2010年,,專注于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域科研服務(wù)。
基于10XNextGEM技術(shù),,單細(xì)胞測(cè)序一次實(shí)驗(yàn)可以同時(shí)檢測(cè)近萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,,可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲3端mRNA表達(dá)譜、如需和免疫組庫(kù)(TCR和BCR)的數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合時(shí),,即某些研究還需結(jié)合基因的表達(dá)譜和V(D)J數(shù)據(jù)進(jìn)行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,,監(jiān)測(cè)免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生,、發(fā)展的分子機(jī)制,,可進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序:烈冰單細(xì)胞免疫組庫(kù)平臺(tái)具備:1000+項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)獲取1000-20000個(gè)細(xì)胞的文庫(kù)構(gòu)建,,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù),;具備完善的免疫組庫(kù)測(cè)序和實(shí)驗(yàn)質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長(zhǎng)序列的配對(duì)信息,;豐富的免疫組庫(kù)測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,實(shí)現(xiàn)專屬個(gè)性化數(shù)據(jù)分析服務(wù),搭配單細(xì)胞分析云平臺(tái),,一鍵導(dǎo)出交互性的動(dòng)態(tài)結(jié)果報(bào)告,。
一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,小心得不償失,,原因在這:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,,通過(guò)降維(pca),,無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí),,無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,,造成聚類結(jié)果失真,。這也是很多文章,特別是很多高分文章,,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。
10×Genomics單細(xì)胞方案要求使用具有較高活性的單細(xì)胞懸液,。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,,我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢愋秃椭苽鋯渭?xì)胞懸液方法的不同,容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況,。去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物對(duì)獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的,。這是因?yàn)椋劳龅募?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái),。這種cell-freeRNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,,并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí),,對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,,需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作),以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量,。單細(xì)胞測(cè)序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,,一度成為高通量測(cè)序技術(shù)的“天花板”。重慶10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角,。武漢二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,,這對(duì)SingleCell分選標(biāo)記,、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率;計(jì)數(shù)偏低,,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過(guò)低,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過(guò)程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有PrimeTreat,、CellLoad,、BeadLoad,、Wash、Lysis,、Retrieval多種操作模式,,來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。武漢二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),,技術(shù)力量雄厚,。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場(chǎng)的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,,與多家企業(yè)合作研究,,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過(guò)不斷改進(jìn),追求新型,,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí),良好的質(zhì)量,、合理的價(jià)格,、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評(píng),。公司業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,,深受廣大客戶的歡迎,。烈冰生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求,通過(guò)**技術(shù),,力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。