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天津高通量測序單細胞測序價格

來源: 發(fā)布時間:2022-08-03

現(xiàn)有的單細胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別,。一個是分隔單個細胞以在其中進行微反應的物理平臺,。在這個空間,,單個細胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別?,F(xiàn)有技術(shù)的另一個主要區(qū)別是如何添加索引,,就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣。10XGenomics單細胞測序平臺采用動態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理),。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,其中一列縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術(shù),,將之輸入到第二縱向孔道,即油相孔道中,。這時候,,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫,。十二年測序經(jīng)驗,累計服務與5000余項重要科研項目,。天津高通量測序單細胞測序價格

基于10XGeomics動態(tài)微流控技術(shù),,利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),形成短片段,,單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,,揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題,區(qū)分細胞異質(zhì)性,,獲得開放染色質(zhì)的位置,、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點,、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細胞表觀遺傳學的重要突破:分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域,,識別細胞類型和細胞狀態(tài),;識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進行譜系和發(fā)育追蹤,;探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列,;探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段,。武漢10X Chromium X單細胞測序百萬通量平臺烈冰專研單細胞多組學測序領(lǐng)域,。

一味的追求高細胞數(shù)量的捕獲,小心得不償失,,原因在這:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,,而細胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,,通過降維(pca),,無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,,因此即使是相同的數(shù)據(jù),,在剔除幾個細胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會出現(xiàn)明顯不同,。而當細胞捕獲數(shù)過多時,無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細胞數(shù)據(jù),,都會對正常細胞聚類產(chǎn)生影響,,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,,為什么單個樣本捕獲細胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數(shù)在3000-5000個時,,數(shù)據(jù)量在100G左右時,,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,,加速科研進程,!此外,,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件,。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,!全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細胞測序平臺,。

高通量測序技術(shù)(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,,已助力Nature,,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。個性化制定測序項目方面,,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求,。陜西10X單細胞測序服務公司

烈冰開展了單細胞轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。天津高通量測序單細胞測序價格

烈冰生物搭建近10臺10XGemomics平臺,,目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學者提供鼓舞,,10X微流體“雙十字”交叉系統(tǒng)為8或16通道系統(tǒng),,每個通道上限可捕獲20000細胞,16通道一次可檢測細胞范圍為百萬級別的細胞水平,。此外,,單個細胞捕獲效率高達65%,可準確鑒別稀有細胞類型,,利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究,;細胞可適性高,對細胞大?。ㄖ睆匠^40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制,。細胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離,,無需人工操作,,1天內(nèi)可完成從細胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準備工作。天津高通量測序單細胞測序價格

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