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上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-03

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù),,液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng),,因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,,微流體通道的直徑約為50~60um,,因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時(shí),,容易出現(xiàn)管道堵塞,,造成GEM生成失敗,對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,,準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候,,往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問題,就是目標(biāo)細(xì)胞,,例如神經(jīng)元細(xì)胞,、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大,不適用于10X單細(xì)胞技術(shù),。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,,直接超過了芯片中管道的直徑,雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um,,但是成熟心肌細(xì)胞的長(zhǎng)度很長(zhǎng),,有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗,這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,,主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,,主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn),。因此可以考慮組織解離后過40um濾網(wǎng),,過濾掉大細(xì)胞,避免出現(xiàn)管道堵塞,、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn),。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過濾掉,丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù),;另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后,,繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,開展細(xì)胞核測(cè)序。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言,,烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答,。烈冰專研單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

SingleCellSequencing技術(shù),,即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,,NextGenerationSequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況,。那么問題來了,,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的,;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞,?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足,;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞,?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,,技術(shù)根本無法普及。所以,,正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生,。吉林10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序價(jià)格單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤。

單細(xì)胞RNA-seq,、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個(gè)共同過程,,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析。不過,,每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),,從而測(cè)定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá)。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),,并通過熒光測(cè)定表達(dá)水平,。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析,。然而,,這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA,,確保來自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞,。與RNA-seq相似,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),,從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)定,。

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),,在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而,單細(xì)胞測(cè)序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,,對(duì)于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái),,5000+項(xiàng)目檢驗(yàn),真實(shí)可信賴,。

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),,也是目前國(guó)內(nèi)和國(guó)際上公認(rèn)的單細(xì)胞測(cè)序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺(tái)技術(shù),該平臺(tái)基于動(dòng)態(tài)微流控原理,,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,,組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本,。基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,是下一個(gè)改變世界的技術(shù),。南通單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,,開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點(diǎn)探索,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,,退行病變,,糖尿病,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來看,,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT 1篇,,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技,、醫(yī)藥科技、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研,、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),,擁有自己**的技術(shù)體系,。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺(tái)與成長(zhǎng)空間,,為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),,深受員工與客戶好評(píng)。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,。公司奉行顧客至上,、質(zhì)量為本的經(jīng)營(yíng)宗旨,深受客戶好評(píng),。公司憑著雄厚的技術(shù)力量,、飽滿的工作態(tài)度、扎實(shí)的工作作風(fēng),、良好的職業(yè)道德,,樹立了良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序形象,贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可,。