關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備,,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,,也就是通過酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液,。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片,。如有必要,,您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定,。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則,那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。強(qiáng)勢(shì)發(fā)文,!烈冰單細(xì)胞測(cè)序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
基于10XGeomics動(dòng)態(tài)微流控技術(shù),,利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),,形成短片段,單細(xì)胞ATAC測(cè)序在表觀基因組學(xué)水平上,,揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題,,區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置,、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn),、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破:分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開放區(qū)域,,識(shí)別細(xì)胞類型和細(xì)胞狀態(tài),;識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,;探究驅(qū)動(dòng)細(xì)胞類型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列,;探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段,。10X Genomics單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái),。
針對(duì)樣本活性的問題,10×Genomics官方建議當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時(shí)應(yīng)做去除死細(xì)胞操作,,但也需要注意到,,去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,10×Genomics和MiltenyiBiotec都沒有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作,?;诹冶嗄陠渭?xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)經(jīng)驗(yàn),建議當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,,考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),,失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。
10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),也是目前國(guó)內(nèi)和國(guó)際上公認(rèn)的單細(xì)胞測(cè)序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺(tái)技術(shù),,該平臺(tái)基于動(dòng)態(tài)微流控原理,,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,組織解離后,,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),,并鑒定細(xì)胞的類型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。烈冰單細(xì)胞測(cè)序,,助力您的深入科學(xué)探究,。
一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲,小心得不償失,,原因在這:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的,。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同,。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),,都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,,特別是很多高分文章,,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí),數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí),,可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求,。烈冰開展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。吉林單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫測(cè)序分析,。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查,、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測(cè)驗(yàn)),,從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī),、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】是我國(guó)國(guó)民經(jīng)濟(jì)重要組成部分之一,,具有高產(chǎn)出、高危險(xiǎn),、高技術(shù)密集型特點(diǎn),,有很強(qiáng)的技術(shù)壁壘。而且對(duì)于保護(hù)和增進(jìn)大家健康,、提高生活質(zhì)量,,為計(jì)劃生育、救災(zāi)防疫,、**戰(zhàn)備以及促進(jìn)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會(huì)進(jìn)步均具有十分重要的作用,。在《2019年本》鼓勵(lì)類條目中增加了“單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序的開發(fā)和生產(chǎn)”。在中藥產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域,,增加了“中藥飲片炮制技術(shù)傳承與創(chuàng)新,,中藥經(jīng)典名方的開發(fā)與生產(chǎn),中藥創(chuàng)新的研發(fā)與生產(chǎn)”等內(nèi)容。根據(jù)單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序相關(guān)領(lǐng)域極新技術(shù)發(fā)展趨勢(shì),,《2019年本》在鼓勵(lì)類條目中新增了新型技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用的有關(guān)內(nèi)容,。例如,在化學(xué)原料藥領(lǐng)域增加了“連續(xù)反應(yīng)”等技術(shù),,在技術(shù)領(lǐng)域增加了“基因醫(yī)治”和“抗體偶聯(lián)”等技術(shù),在藥用包裝材料領(lǐng)域增加了“中性硼硅藥用玻璃”等新型材料與技術(shù)的開發(fā)應(yīng)用,,在醫(yī)藥領(lǐng)域增加了“人工智能輔助醫(yī)藥設(shè)備”等新技術(shù)內(nèi)容,。隨著西方健康服務(wù)理念的進(jìn)入及國(guó)內(nèi)需求市場(chǎng)的飛速增長(zhǎng),國(guó)內(nèi)以體檢為重點(diǎn)的有限責(zé)任公司(自然)得到了飛速發(fā)展,,尤其是近年來,,健康服務(wù)機(jī)構(gòu)飛速發(fā)展。盡管中國(guó)老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段,,但近年來我國(guó)出臺(tái)了一些扶持政策,,市場(chǎng)空間逐漸打開。重慶高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主要經(jīng)營(yíng)范圍是醫(yī)藥健康,,擁有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場(chǎng)口碑,。公司業(yè)務(wù)分為單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),,空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),,為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù),。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì),、強(qiáng)大的技術(shù),,還有一批專業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù),。烈冰生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品,、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來的聲譽(yù)和口碑,,讓企業(yè)發(fā)展再上新高,。