單細(xì)胞多組學(xué)提升見(jiàn)解基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo),。如果說(shuō)單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來(lái)樣本的真實(shí)視圖,。烈冰2021年強(qiáng)勢(shì)引進(jìn)的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺(tái)能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征,。與傳統(tǒng)方法不同,，單細(xì)胞多組學(xué)簡(jiǎn)化了您需要開(kāi)展的實(shí)驗(yàn),，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果,。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過(guò)計(jì)算來(lái)推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系,。烈冰專(zhuān)精單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域,。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),，在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值,。然而，單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,，對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,，無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。沈陽(yáng)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)支持個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,，滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求,。

關(guān)于10XGenomics單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類(lèi)型和樣本制備：10X平臺(tái)在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、無(wú)細(xì)胞隨便,、極少的細(xì)胞團(tuán)塊，且細(xì)胞活力高（＞70%）,；此外,，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的10XGenomics平臺(tái)兼容,。一般來(lái)說(shuō)，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類(lèi)型而變化,。每種組織類(lèi)型都是獨(dú)特的,，因此，必須在開(kāi)始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),，累積10+物種、50+組織的消化protocol,，若您的樣本為組織,，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助,。

10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),，也是目前國(guó)內(nèi)和國(guó)際上公認(rèn)的單細(xì)胞測(cè)序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺(tái)技術(shù)，該平臺(tái)基于動(dòng)態(tài)微流控原理,，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,，組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,， 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,，可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本,。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測(cè)序服務(wù),。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中：以捕獲5000個(gè)細(xì)胞,、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn),，每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類(lèi)型,，例如成熟的B,，T，粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,，由于該類(lèi)型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,，導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織,、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,，他們的基因表達(dá)數(shù)較高，甚至可以超過(guò)1W,，這就導(dǎo)致該類(lèi)樣本基因中位數(shù)非常高,。因此，我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí),，需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成,。烈冰專(zhuān)研單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。西安高通量測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序商業(yè)化服務(wù)

烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度,、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測(cè)序,。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化,、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟,，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,，或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類(lèi)型,。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟,，具體取決于組織質(zhì)量,、樣本豐度,、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析,。無(wú)論具體的考慮因素如何,，所有樣本類(lèi)型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液,。烈冰科技單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)

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