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蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-13

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表,;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap,、Violin圖,,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀,。平臺上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,,節(jié)省您的工作時(shí)間并提升整體工作效率,。單細(xì)胞組學(xué)通過一系列測序技術(shù)實(shí)現(xiàn)高分辨檢測單個(gè)細(xì)胞水平表達(dá)譜,以解析細(xì)胞異質(zhì)性及其功能表型,。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺

SingleCellSequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,,NextGenerationSequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,,如何獲得單個(gè)細(xì)胞,?如果無法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞,?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬級別以上,,如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞,?單細(xì)胞測序成本非常高,,尤其是需要測2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,,技術(shù)根本無法普及,。所以,正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測序在單個(gè)細(xì)胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足,,直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生,。北京single cell 單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持隨著組學(xué)新技術(shù)的不斷涌現(xiàn),高通量的方向發(fā)展,,通過對多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析,,已成為科研究新方向。

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細(xì)胞測序的結(jié)果不同,,這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn),。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá),。那么這個(gè)時(shí)候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了,。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達(dá),,即無有效Spot位點(diǎn),。同樣的,另一個(gè)就是組織切片的大小,,也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量,。

單細(xì)胞測序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細(xì)胞組學(xué)分析面臨的兩個(gè)瓶頸:一是大量細(xì)胞的混合測序會掩蓋細(xì)胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測序技術(shù)需要大量的細(xì)胞作為起始,細(xì)胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細(xì)胞測序方法不僅能夠揭示組織中的細(xì)胞類型和稀有亞群,、細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)的變化,還可以研究細(xì)胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育,、衰老和疾病發(fā)展的機(jī)制。隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,、基因組,、表觀遺傳組、蛋白組等各組學(xué)測序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開始將它們相互組合,使得單個(gè)細(xì)胞或同類細(xì)胞的多個(gè)組學(xué)數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)能夠更有效地研究細(xì)胞在特定時(shí)空狀態(tài)下各組學(xué)間的復(fù)雜聯(lián)系,從而揭示細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)調(diào)控的分子機(jī)制,。未來,,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展。

單細(xì)胞測序技術(shù)(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測序手段,,幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境,、發(fā)育學(xué),、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題,。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來支撐,。BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的完善質(zhì)控,。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),,在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對單細(xì)胞測序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,,幫助研究者在單細(xì)胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)已應(yīng)用于心肌再生領(lǐng)域,。深圳scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

以單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為中心的多組學(xué)聯(lián)合分析有利于更好地理解基因變化與表型變化之間的關(guān)聯(lián)性,。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺

所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化,、加接頭,制備測序文庫,,通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),,檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢,,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。?,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,,開展項(xiàng)目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,,如果匹配,,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺如何選擇,,樣本如何制備,,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴,。蘇州BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。一批專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),,是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),,是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動力。誠實(shí),、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,,也是我們做人的基本準(zhǔn)則。公司致力于打造***的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,。公司深耕單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間,、更寬泛的領(lǐng)域拓展,。