空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分,；2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義,；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值。每一個(gè)部分都不可或缺,，其結(jié)果都對(duì)后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響,。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì),。右端普遍為捕獲的RNA序列,。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過(guò)濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷,。隨后,，采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析,，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。在單細(xì)胞水平上的多組學(xué)分析能夠?yàn)檠芯拷M提供前所未有的臨床和科研大數(shù)據(jù),。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化

單細(xì)胞技術(shù)讓我們?cè)诨蚪M學(xué),、表觀基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等層面上解析了許多錯(cuò)綜復(fù)雜的生命密碼,。隨著科技的進(jìn)步,，我們發(fā)現(xiàn)整合多個(gè)組學(xué)的信息可以更仔細(xì)地觀察細(xì)胞之間的可變性，更清楚地識(shí)別特定細(xì)胞及其功能,。單細(xì)胞多組學(xué)在臨床診斷,、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機(jī)制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用也將越來(lái)越廣。單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在,，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組,，而是擴(kuò)展到了基因組、免疫組,、表觀組,、蛋白組等多組學(xué)水平。合肥高通量測(cè)序單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在,，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組,，擴(kuò)展到了基因組、免疫組,、蛋白組等多組學(xué)水平,。

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),，在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值,。然而，單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,，對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,，無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性,。

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)（SingleCellSequencing）從一種新興的研究角度,，借助已有的高通量測(cè)序手段，幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境,、發(fā)育學(xué),、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了BulkPopulationSequencing所無(wú)法解決的問(wèn)題,。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來(lái)支撐,。BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過(guò)程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的完善質(zhì)控,。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng),，在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞懸液制備之后,，又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,，幫助研究者在單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域收獲更多的成果。為了能深入分析和理解細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)決定的機(jī)制, 將單細(xì)胞各組學(xué)技術(shù)結(jié)合在一起的單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生,。

SingleCellSequencing技術(shù),，即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)（NGS，NextGenerationSequencing）分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況,。那么問(wèn)題來(lái)了，如何獲得單個(gè)細(xì)胞,？如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的,；如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞？單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上,，如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足,；如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞？單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,，尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,，如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無(wú)法普及,。所以,，正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足，直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生,。在單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的支持下,早期妊娠母胎界面的異質(zhì)性問(wèn)題得到了更深入的闡述與理解,。無(wú)錫烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)

單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進(jìn)程的變化，因此多組學(xué)聯(lián)合分析成為解析生命進(jìn)程的有力工具,。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國(guó)際前沿、整合添加多項(xiàng)國(guó)際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程,；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果，詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過(guò)程后,，就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進(jìn)行Spot的Cluster的過(guò)程,，熟悉單細(xì)胞測(cè)序的研究者知道,，Cluster在單細(xì)胞測(cè)序中往往表示為細(xì)胞的類型，也就是說(shuō)能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype（當(dāng)然分情況也會(huì)有不同）,。而在空轉(zhuǎn)中,，也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性，導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,，而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,，或者說(shuō)是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),，發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,。一批專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),，是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動(dòng)力,。誠(chéng)實(shí)、守信是對(duì)企業(yè)的經(jīng)營(yíng)要求,，也是我們做人的基本準(zhǔn)則,。公司致力于打造***的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。公司深耕單細(xì)胞測(cè)序,，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,，正積蓄著更大的能量,，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展,。