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青島高通量測序單細(xì)胞多組學(xué)平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-08-19

冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲,、文庫構(gòu)建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,,通過甲醛固定,、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進(jìn)行透化處理,,使細(xì)胞中的mRNA釋放,,并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進(jìn)行上機(jī)測序,,從而獲取基因表達(dá)信息,??傮w來說,空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機(jī)測序,,而需要客戶進(jìn)行樣本準(zhǔn)備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋,。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。青島高通量測序單細(xì)胞多組學(xué)平臺

隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(scRNA-Seq)的蓬勃發(fā)展,,其在在胚胎發(fā)育,,腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性,免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)化等多方面屢建奇功,,但是由于細(xì)胞形態(tài)的不同和單細(xì)胞制備中細(xì)胞敏感性的差異等因素影響,,scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細(xì)胞類型占比失真,個別細(xì)胞類型丟失等情況,。為了克服單細(xì)胞測序技術(shù)的局限性,,單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(snRNA-Seq)應(yīng)運(yùn)而生,snRNA-Seq可利用凍存組織直接制備單細(xì)胞核進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,,不僅克服了細(xì)胞形態(tài)差異致使的細(xì)胞捕獲差異,,還克服了單細(xì)胞測序必須使用新鮮樣本的多個局限性。深圳烈冰單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)基于單細(xì)胞測序技術(shù)和高通量組學(xué)方法發(fā)展而來,能在單細(xì)胞分辨率下同時整合多種組學(xué)信息,。

單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,,可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值,。然而,,單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程,、病理微環(huán)境都存在很大的局限性,。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序,,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況,。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入,,無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢:1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫,,大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量,;2. 不同層面表達(dá)水平分析,構(gòu)建表達(dá)“全景圖”,;3. 多組學(xué)交叉驗證:深層次挖掘其中調(diào)控機(jī)制,;4. 對基因突變信息在蛋白水平上進(jìn)行驗證;5.精細(xì)醫(yī)療:實現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個研究方面,,1. 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,,生長發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等,;2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,,致病機(jī)理研究等;3. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué),、臨床診斷:生物標(biāo)志物,,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型等,;4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,,藥效評價,藥物開發(fā)等,;5. 微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等,;6. 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等,;7. 生物能源,、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),,環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等,;8.食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,,功能性食品開發(fā),,食品安全監(jiān)檢測等。單細(xì)胞多組學(xué) 測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時 進(jìn)行的方法,。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段:1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分,;2.Spot點陣的分群與定義;3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值,。每一個部分都不可或缺,,其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的,,都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計,。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可,,左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷,。隨后,采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析,解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣,。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在多個研究領(lǐng)域都發(fā)揮了重要的推進(jìn)作用,揭示了組織中微量的細(xì)胞類型和基因表達(dá)特征,。無錫烈冰科技單細(xì)胞多組學(xué)測序價格

未來,,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展。青島高通量測序單細(xì)胞多組學(xué)平臺

我國經(jīng)濟(jì)進(jìn)入“新常態(tài)”,,總體上推動單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序從粗放式增長向注重質(zhì)量,、效率方向轉(zhuǎn)變。民間資本的進(jìn)入也一定程度刺激我國單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序市場活力,。社會對健康類產(chǎn)業(yè)的關(guān)注度越來越高,,迫切需要對單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,,單細(xì)胞多組學(xué)測序的規(guī)模和結(jié)構(gòu)進(jìn)行核算。監(jiān)管體系缺失,,山東的疫苗事件中,,體現(xiàn)出銷往24個省市的疫苗各方面監(jiān)管力度小。制藥企業(yè)和各大醫(yī)藥機(jī)構(gòu)由不同部門管理,,這種分段監(jiān)管方式存在很大的醫(yī)藥健康漏洞,。醫(yī)藥健康方面人才培養(yǎng)體制貧乏,經(jīng)調(diào)查,,中國的大學(xué)中把物流管理與醫(yī)藥知識結(jié)合的專業(yè)少之又少,,單方面精通的人才對于醫(yī)藥冷鏈物流無法完全勝任,通過調(diào)研冷鏈物流企業(yè),,了解到培養(yǎng)物流人員有關(guān)冷鏈物流的相關(guān)知識來勝任冷鏈物流工作的計劃進(jìn)展緩慢,,使得人才成為完善醫(yī)藥健康的重要制約因素。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃,,醫(yī)用物流公司十分分散,,許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高,,存儲倉庫與冷藏運(yùn)輸車等的建設(shè)與運(yùn)行成本便居高不下,,使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設(shè)到運(yùn)營中的成本都遠(yuǎn)超于傳統(tǒng)物流成本。青島高通量測序單細(xì)胞多組學(xué)平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊不斷壯大,現(xiàn)有一支專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊,,各種專業(yè)設(shè)備齊全,。專業(yè)的團(tuán)隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,,致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌,。公司堅持以客戶為中心、生物科技,、醫(yī)藥科技,、信息科技、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā),、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研,、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),,計算機(jī),、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】市場為導(dǎo)向,重信譽(yù),,保質(zhì)量,,想客戶之所想,急用戶之所急,,全力以赴滿足客戶的一切需要,。自公司成立以來,一直秉承“以質(zhì)量求生存,,以信譽(yù)求發(fā)展”的經(jīng)營理念,,始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,為客戶提供良好的單細(xì)胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,,從而使公司不斷發(fā)展壯大,。