空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,,得出形態(tài)學結(jié)論,,通過觀察基因表達區(qū)域,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,,研究免疫細胞浸潤,、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散,、不同類型免疫細胞的空間位置解析,; 在神經(jīng)科學,研究大腦皮層層狀組織解析,,揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,,正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學,,通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征,,解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因;豐富基因表達的空間注釋信息,,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜,。自主研發(fā)PanoCell單細胞實驗測序平臺,。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq,。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確,、基因和細胞檢測量的限制等問題,。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案,。烈冰科技自2020年起,,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序,、AbSeq,、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序),、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),,多組學聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息,。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案,!溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)十二年測序經(jīng)驗,累計服務(wù)與5000余項重要科研項目,。
所謂的高通量測序技術(shù),,又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化,、加接頭,,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),,成為目前組學研究的主要技術(shù),。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,,實驗平臺如何選擇,,樣本如何制備,,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,,從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,,幫助您快速定位項目訴求,,提供從實驗設(shè)計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴,。
為同時獲得空間表達和組織學背景信息,,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量,。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題,,針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly(dA)序列進行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針(RTL)與mRNA雜交,。左側(cè)探針(LHS)具有部分Read 2序列,,右側(cè)探針(RHS)具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接,,而mRNA被RNase降解,。組織透化后,被連接的成對探針與芯片上包含空間Barcode,、UMI和poly(dT)序列的引物序列捕獲,,并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進行測序文庫構(gòu)建和測序,。測序序列上的空間Barcode用于將測序序列定位到組織切片圖像上,,UMI用于基因表達定量。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù),。
空間組測序技術(shù),,作為現(xiàn)階段單細胞技術(shù)的重要補充技術(shù)進入了組學的實驗領(lǐng)域以及生物信息學的分析領(lǐng)域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),,多角度深入分析組織的形態(tài)特征,、基因組學特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境,。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,,空間轉(zhuǎn)錄組分析實際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,,一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),,也是重中之重??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新,。合肥上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組平臺
空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼,。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
基因測序是基因檢測的方法之一,,其又叫基因譜測序,是國際上公認的一種基因檢測標準,。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),,足見其劃時代的改變,,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing),?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,可以說,,基因測序技術(shù)將是下一個改變世界的技術(shù),。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,,為員工打造良好的辦公環(huán)境,。在烈冰生物近多年發(fā)展歷史,公司旗下現(xiàn)有品牌NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造等,。我公司擁有強大的技術(shù)實力,,多年來一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技,、信息科技,、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù),、技術(shù)轉(zhuǎn)讓,、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查,、社會調(diào)研、民意調(diào)查,、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),,計算機,、軟件及耗材(除專控),,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的發(fā)展和創(chuàng)新,,打造高指標產(chǎn)品和服務(wù)。誠實,、守信是對企業(yè)的經(jīng)營要求,,也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的單細胞測序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,。