烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),,能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快,、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表,;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot,;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖,、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖,、Heatmap、Violin圖,,還可以通過(guò)調(diào)節(jié)寬,、高和系數(shù)比例來(lái)調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具,、50+pipeline工作流模板,,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,節(jié)省您的工作時(shí)間并提升整體工作效率,。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,,開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。蘇州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格
已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq,。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大,,或是存在有效測(cè)序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達(dá)解決方案是目前一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準(zhǔn)方法中,,從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達(dá)情況,同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。北京烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化烈冰一站式多平臺(tái)測(cè)序服務(wù):立足科學(xué)研究,,解碼生命本質(zhì),。
空間組測(cè)序技術(shù),作為現(xiàn)階段單細(xì)胞技術(shù)的重要補(bǔ)充技術(shù)進(jìn)入了組學(xué)的實(shí)驗(yàn)領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域,。通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序(單細(xì)胞表達(dá)尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(空間表達(dá)尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時(shí)間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),,多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征,、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境,。不同于單細(xì)胞測(cè)序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動(dòng)的,,尤其是對(duì)于組織切片的理解,,一個(gè)在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),也是重中之重,。
空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段:1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分,;2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義;3.Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值,。每一個(gè)部分都不可或缺,,其結(jié)果都對(duì)后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的,,都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì),。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過(guò)濾策略即可,,左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷,。隨后,采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析,,解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序機(jī)構(gòu),,請(qǐng)認(rèn)準(zhǔn)上海烈冰生物科技,。
在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界,。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評(píng)價(jià)為2020年度方法,,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來(lái)越受到歡迎,,它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進(jìn)入新的階段,。從轉(zhuǎn)錄組測(cè)序到實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測(cè)序,這一過(guò)程為精確認(rèn)識(shí)不同細(xì)胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來(lái)轉(zhuǎn)錄組信息,同時(shí)還提供空間信息,,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,,進(jìn)一步擴(kuò)展到單細(xì)胞分辨率,,這會(huì)更大程度提升科學(xué)家對(duì)單個(gè)細(xì)胞的認(rèn)識(shí)和解讀。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界,。重慶烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),,烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。蘇州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),,先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序,、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭,。2018年以來(lái),烈冰依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),,為用戶提供一站式全流程的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)和解決方案,。烈冰經(jīng)過(guò)十幾年的經(jīng)歷,已具備大鼠,、小鼠,、斑馬魚、猴,、裸鼴鼠,、水稻、擬南芥等10+物種,,皮膚,、腦、胰腺,、脂肪,、心臟、花序等50+組織類型,,100+細(xì)胞類型,,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn),。蘇州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),,技術(shù)力量雄厚。公司致力于為客戶提供安全,、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),,是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè)。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,,致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序,。烈冰生物自成立以來(lái),,一直堅(jiān)持走正規(guī)化、專業(yè)化路線,,得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持,。