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武漢二代測序單細胞測序商業(yè)化服務

來源: 發(fā)布時間:2022-08-26

烈冰科技專注為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務,,先后經(jīng)歷基因芯片時代,、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭,。2018年以來,單細胞測序進入發(fā)展的快車道,,烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,,依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案,。4年的單細胞技術的積累,,烈冰已具備大鼠、小鼠,、斑馬魚,、猴、裸鼴鼠,、水稻,、擬南芥等10+物種,,皮膚、腦,、脂肪,、心臟、花序等50+組織類型,,100+細胞類型,,1000+靶標基因,10000+樣本處理經(jīng)驗,。個性化制定測序項目方面,,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。武漢二代測序單細胞測序商業(yè)化服務

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結果,,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷,、結果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,,加速科研進程,!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),,不但可以將海量復雜的結果文件可視化,,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,,詳情請咨詢烈冰生物。寧波上海烈冰單細胞測序單細胞科聯(lián)合空間轉錄組,,展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,,揭示精細病理區(qū)域中“喚醒”的信號通路。

單細胞RNA-seq,、RNA-seq和逆轉錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個共同過程,,即分離RNA并將其轉化為cDNA進行分析。不過,,每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同,。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA,然后將其轉化為cDNA,。RNA-seq是使用cDNA來構建新一代測序文庫,,從而測定整個轉錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點,并通過熒光測定表達水平,。RT-qPCR限于已知靶點,,而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉錄組基因表達分析。然而,,這兩者只能提供細胞群體內基因表達的平均情況,。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應容器中。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA,,確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞,。與RNA-seq相似,帶有條形碼的cDNA也被用于構建新一代測序文庫,,從而能夠對每個細胞的整個轉錄組進行基因表達測定,。

10XGenomics和Drop-Seq具有類似的技術原理。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,,一列縱向孔道輸入細胞,,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術,,將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中。這時候,,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,,構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構建文庫,。全線搭建10x Genomics單細胞測序平臺,。

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性,。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞轉錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構,,無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息,。而空間轉錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息,,在保留組織形態(tài)結構的基礎上,,獲得細胞/基因的空間表達特異性。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代,。重慶二代測序單細胞測序技術支持

烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務,。武漢二代測序單細胞測序商業(yè)化服務

關于單細胞測序實驗樣本制備,這與流式細胞術用戶熟悉的步驟完全一致,,也就是通過酶促或機械消化,、細胞分選或其他細胞分離技術從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液,。隨后是細胞計數(shù)和質量控制步驟,以確保您的樣本有適當濃度的活細胞,,并且不含細胞團塊和死細胞碎片,。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進行染色,,標記細胞表面蛋白或其他生物分析物,,或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗目標而定,。也許需要額外的制備步驟,,具體取決于組織質量、樣本豐度,、細胞大小,,以及是否需要提取出細胞核進行染色質可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,,那就是生成高質量的單細胞懸液。武漢二代測序單細胞測序商業(yè)化服務

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