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單細胞測序百萬通量平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-08-26

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路,、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細胞,、組織和生物體的運作,。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要,?!睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn),科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。截至2021年10月,,烈冰助力發(fā)表單細胞測序文章近20篇。單細胞測序百萬通量平臺

烈冰與國內(nèi)高校,、研究所,、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構(gòu),,1000+客戶和5000+重要科研項目,,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領(lǐng)域,,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,,包含Immunity,、NatureCellBiology、NaturePlants,、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學術(shù)期刊,,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,,免疫研究,、腦神經(jīng),、白血病,、胚胎發(fā)育、糖尿病,、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等,。合肥上海烈冰單細胞測序烈冰專研單細胞多組學測序領(lǐng)域,。

現(xiàn)有的單細胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別。一個是分隔單個細胞以在其中進行微反應的物理平臺,。在這個空間,,單個細胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,,以便下游識別?,F(xiàn)有技術(shù)的另一個主要區(qū)別是如何添加索引,就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣,。10XGenomics單細胞測序平臺采用動態(tài)微流控技(Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理),。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,其中一列縱向孔道輸入細胞,,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術(shù),將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中,。這時候,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫。

科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,,如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展,以及對多種用藥的反應,。單細胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液,,或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核,進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結(jié)果的技術(shù),,其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么?免疫研究中,,兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細胞在組織切片上風馬牛不相及,,這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么?烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。

單細胞測序技術(shù)(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質(zhì)性,、免疫微環(huán)境,、發(fā)育學,、免疫學以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題,。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐,。BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的準確質(zhì)控,。NovelBio單細胞實驗團隊借助BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng),,在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,,幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務,。西安10X Chromium X單細胞測序商業(yè)化服務

單細胞多組學測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,,進行譜系和發(fā)育追蹤。單細胞測序百萬通量平臺

細胞計數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時,,需要在細胞清洗和過濾之后測定細胞活力,,這一點至關(guān)重要。測定細胞活力有許多種方法,,烈冰多年單細胞測序經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)臺盼藍法在鑒定活細胞與死細胞的比例時效果很好,。細胞計數(shù)的準確性以及目標回收量和實際回收量之間的一致性,取決于我們了解樣本中有多少個細胞,。一旦過濾和清洗完成,,可采用細胞計數(shù)設備(如血球計數(shù)器或自動細胞計數(shù)儀)進行定量。這些設備不但能提供準確的細胞計數(shù),,還能計算出向微流體芯片上樣適量細胞所需的細胞懸液體積,。單細胞測序百萬通量平臺

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