已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大，或是存在有效測(cè)序深度不足等問(wèn)題,。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達(dá)解決方案是目前一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準(zhǔn)方法中，從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達(dá)情況,，同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,，進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤,。烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù)，包括樣本包埋,、貼片,、選片、HE染色,、拍照成像,、組織透化、建庫(kù)測(cè)序以及后續(xù)的FISH驗(yàn)證等各個(gè)步驟,，為您提供無(wú)憂服務(wù),。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機(jī)、尼康多熒光通路全自動(dòng)掃描顯微鏡,、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)平臺(tái),，并制定嚴(yán)格規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP，經(jīng)過(guò)大量的切片,、貼片實(shí)操演練,，對(duì)不同類型組織的切片厚度、溫度進(jìn)行優(yōu)化,，確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片,。利用NovelBrain云分析平臺(tái)，搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,，準(zhǔn)確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,，判定空間區(qū)域內(nèi)的細(xì)胞類別,，精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。重慶BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)烈冰開展了空間轉(zhuǎn)錄組,、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,。

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作,、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單,，不需要命令行操作,。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如,；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量,、線粒體RNA占比信息,；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量,、RNA表達(dá)量,、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等,；3D立體展示,，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況,。

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在組織原位檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)的?種技術(shù)，可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達(dá)情況,，同時(shí)能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相?,，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序漿病理影像（H&E染?）與測(cè)序數(shù)據(jù)映射在?起,，進(jìn)?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細(xì)胞異質(zhì)性。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,，而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息,。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,，將成為發(fā)育生物學(xué),、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器,。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),，烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬(wàn)倍,，保證過(guò)程中足夠的測(cè)序深度,。測(cè)序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP：1）堿基上通過(guò)敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán)，用于區(qū)分ATCG,；2）3端使用疊氮基團(tuán)封閉,，保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí),，會(huì)通過(guò)高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,，再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán),，開啟下一循環(huán)。通過(guò)分析讀取同一位點(diǎn)的熒光,，實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列,。由于過(guò)程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會(huì)出現(xiàn)不同步的情況,，因此Illumina的讀長(zhǎng)只能限制在200bp左右,。烈冰一站式多平臺(tái)測(cè)序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì),。寧波上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

截至2021年10月,，烈冰助力發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文章近20篇。烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在病理學(xué)中,，通過(guò)添加基因表達(dá)維度,，得出形態(tài)學(xué)結(jié)論，通過(guò)觀察基因表達(dá)區(qū)域,，了解可能發(fā)生假陰性/假陽(yáng)性的位置; 在免疫學(xué),，研究免疫細(xì)胞浸潤(rùn)、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征,；免疫群體擴(kuò)散,、不同類型免疫細(xì)胞的空間位置解析； 在神經(jīng)科學(xué),，研究大腦皮層層狀組織解析,，揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系，正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層,； 在發(fā)育生物學(xué),，通過(guò)解析每個(gè)發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征，解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因,；豐富基因表達(dá)的空間注釋信息,，創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序價(jià)格

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