烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,；從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程,！此外,，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,，還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn),。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您,！單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進(jìn)程的變化,，因此多組學(xué)聯(lián)合分析成為解析生命進(jìn)程的有力工具。北京scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”,；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被“沉默”,，一些基因被重新“喚醒”,，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài),。擬時(shí)序分析,，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡,。即使在同一個(gè)樣本中,，也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,，不論測定了多少樣本,，我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。廣州single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測序服務(wù)單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花,，烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼,。

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴(kuò)增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度,。測序時(shí)使用特殊標(biāo)記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團(tuán),，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團(tuán)封閉,，保證一次循環(huán)只上一個(gè)dNTP,。每一輪循環(huán)結(jié)束時(shí)，會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,，再通入試劑除去熒光基團(tuán)和疊氮基團(tuán),，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點(diǎn)的熒光,，實(shí)時(shí)獲取模版鏈的堿基序列,。由于過程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況,，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右,。

當(dāng)下，單細(xì)胞測序已經(jīng)廣泛應(yīng)用于多種疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,，如疾病從輕癥病變向惡性的轉(zhuǎn)化,、惡性向轉(zhuǎn)移病變的發(fā)展,，以及疾病對多種藥物的反應(yīng)等等。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個(gè)需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,，或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,，進(jìn)而對于每一個(gè)單細(xì)胞或者細(xì)胞核進(jìn)行測序得到結(jié)果的技術(shù)，其空間定位信息是丟失的,。這就衍生出了一個(gè)問題就是如果單細(xì)胞A與B并不出現(xiàn)在一個(gè)組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么,？免疫研究中，兩個(gè)具有非常強(qiáng)的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細(xì)胞在組織切片上風(fēng)馬牛不相及,，這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么,？為了能深入分析和理解細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)決定的機(jī)制, 將單細(xì)胞各組學(xué)技術(shù)結(jié)合在一起的單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生。

烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國際前沿,、整合添加多項(xiàng)國際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測序分析結(jié)果,，詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后,，就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進(jìn)行Spot的Cluster的過程,，熟悉單細(xì)胞測序的研究者知道,，Cluster在單細(xì)胞測序中往往表示為細(xì)胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype（當(dāng)然分情況也會有不同）,。而在空轉(zhuǎn)中,，也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性，導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,，而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域,，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。烈冰生物為您提供一站式全流程單細(xì)胞測序服務(wù),。廈門上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺,，開啟百萬級通量單細(xì)胞測序新時(shí)代。北京scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細(xì)胞測序的結(jié)果不同,，這里存在一個(gè)概念叫做NumberofSpotsundertissue,，即，空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點(diǎn),。這個(gè)有效Spot的篩選標(biāo)準(zhǔn)是有UMI以及有序列表達(dá),。那么這個(gè)時(shí)候，貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點(diǎn)了,。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,，那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,，但是沒有基因表達(dá)，即無有效Spot位點(diǎn),。同樣的,，另一個(gè)就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個(gè)玻片的覆蓋面積越小,，分析的有效區(qū)域就越少,。這兩者基本上決定了整個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。北京scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

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