對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言,,常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜,,在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析,并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(lèi)(cellcluster)為討論對(duì)象,,而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象,因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格,,但是單細(xì)胞測(cè)序,特別是目的為圖譜研究時(shí),需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度(增加樣本數(shù)),,盡可能的構(gòu)建某一疾病類(lèi)型、群體細(xì)胞圖譜信息,。因此,,單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù),不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲,、建庫(kù),、測(cè)序,以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù),,單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí),,后續(xù)分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,,保證分析的完備準(zhǔn)確性,。基于“靜態(tài)蜂巢”技術(shù),,實(shí)現(xiàn)落孔細(xì)胞的物力分割和磁珠的一對(duì)一匹配,。陜西BD單細(xì)胞平臺(tái)
多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶(hù)定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷,、結(jié)果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,,加速科研進(jìn)程,!廣州BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)BD Scanner,是您實(shí)驗(yàn)過(guò)程的又一雙眼睛,,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),,精細(xì)質(zhì)控。
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,,從平臺(tái)應(yīng)用比例來(lái)看,應(yīng)用10XGenomics和BDRhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,,研究類(lèi)型涵蓋疾病發(fā)展,,靶點(diǎn)探索,免疫研究,,神經(jīng)發(fā)育,,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,,退行病變,,糖尿病,COVID-19等等研究,;從發(fā)表期刊水平來(lái)看,,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,,其中包括immunity三篇,,Nature子刊3篇(Naturecellbiology,NaturePlants,Naturecommunication),風(fēng)濕類(lèi)領(lǐng)域ARD期刊1篇,,CUT1篇,,AdvancedScience多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,,烈冰專(zhuān)屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),,將與您攜手譜寫(xiě)下一篇“高分”新文章。
對(duì)于稀有樣本,,或細(xì)胞量比較少的稀有組織,,樣本中每一粒細(xì)胞都很珍貴,BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)該種類(lèi)型的樣本能實(shí)現(xiàn)友好包容,,如果在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中,,我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢?lèi)型和制備單細(xì)胞懸液方法的不同,容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況,。也會(huì)和您探討是否考慮去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物的操作,,以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)?,死亡的?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái)。這種cell-freeRNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲,,并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量,。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí),對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后,需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作),,以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量,。單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),烈冰提供高性?xún)r(jià)比服務(wù)方案,。
烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái),,采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功: 1.制備單細(xì)胞懸液:可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液;系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計(jì),,無(wú)需擔(dān)心通道堵寨,;通過(guò)重力輕輕沉淀細(xì)胞,可捕獲脆弱細(xì)胞,,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個(gè)分區(qū),,可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個(gè)細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描:估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細(xì)胞和磁珠的微孔數(shù)量;測(cè)定細(xì)胞存留率,,評(píng)估是否發(fā)生細(xì)胞損失 (5)細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液,,確保細(xì)胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息,;助力醫(yī)療健康時(shí)代,!杭州BD單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序
烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。陜西BD單細(xì)胞平臺(tái)
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能解析,,越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間),。陜西BD單細(xì)胞平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景,、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治,、展望未來(lái),、有夢(mèng)想有目標(biāo),有組織有體系的公司,,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明,,攜手共畫(huà)藍(lán)圖,,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶(hù)粉絲源,也收獲了良好的用戶(hù)口碑,,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),,也希望未來(lái)公司能成為*****,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**上海烈冰生物醫(yī)藥科技供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績(jī),,一直以來(lái),,公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展,、誠(chéng)實(shí)守信的方針,,員工精誠(chéng)努力,協(xié)同奮取,,以品質(zhì),、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng),我們一直在路上,!