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西安10X Genomics單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-15

10XGenomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理,。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,一列縱向孔道輸入細(xì)胞,凝膠微珠與細(xì)胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,,并通過微流控技術(shù),,將之輸入到第二縱向孔道,,即油相孔道中,。這時(shí)候,就形成了一個(gè)個(gè)油滴并輸出并收集在EP管中,。每一個(gè)油滴中會落入一個(gè)細(xì)胞以及一個(gè)凝膠微珠,,那么在每一個(gè)凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠,。而這個(gè)凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。西安10X Genomics單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

烈冰生物成立于2010年,與時(shí)俱進(jìn),,堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù),,已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測服務(wù)****,。專注于“單細(xì)胞測序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,在上海,、北京,、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場所,,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷,、運(yùn)營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市****,,60+項(xiàng)自主知識產(chǎn)權(quán),,轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測序,,核測序,,單細(xì)胞多組學(xué),空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺,。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院,、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開發(fā),、科學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)及臨床研究,疾病分子標(biāo)志物篩選,、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次,、多組學(xué)檢測服務(wù)和解決方案,助力300+CNS國際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,,IF10+文章占比>65%。西安10X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,烈冰配套全程個(gè)性化,、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。

單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,,可實(shí)現(xiàn)零代碼操作,、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作,。簡單拖拽,、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如,;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),,UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息,;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量,、基因表達(dá)量,、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布,、線粒體RNA表達(dá)量等,;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖,、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。

從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角,。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá),、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間)。烈冰單細(xì)胞測序,,助力您的深入科學(xué)探究,。

針對樣本活性的問題,10×Genomics官方建議當(dāng)單細(xì)胞懸液活性低于70%時(shí)應(yīng)做去除死細(xì)胞操作,,但也需要注意到,,去除死細(xì)胞的操作會損失一定的細(xì)胞數(shù)量,10×Genomics和MiltenyiBiotec都沒有給出單細(xì)胞懸液含有多少細(xì)胞數(shù)量才建議做去除死細(xì)胞的操作,?;诹冶嗄陠渭?xì)胞測序?qū)嶒?yàn)經(jīng)驗(yàn),建議當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測后,,考慮對細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),,失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,。全線搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測序平臺。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序服務(wù)機(jī)構(gòu)

全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細(xì)胞測序平臺。西安10X Genomics單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!西安10X Genomics單細(xì)胞測序商業(yè)化服務(wù)

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