多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率,。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,,需要進(jìn)行Downsample處理,,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量,、基因表達(dá)水平的差異,。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),,深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義,;從操作便捷、結(jié)果可視化,、分析可追溯,、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程,!單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開(kāi)花,,烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。scRNA單細(xì)胞
BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,,針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本,采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞,,基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),,并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。廣東BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破,。
單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量,、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,,這對(duì)SingleCell分選標(biāo)記,、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用,。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率;計(jì)數(shù)偏低,,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例,;而細(xì)胞活率過(guò)低,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要,。而在鋪板過(guò)程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果,。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專(zhuān)門(mén)定制的電動(dòng)移液器,其具有PrimeTreat,、CellLoad,、BeadLoad、Wash,、Lysis,、Retrieval多種操作模式,來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作,。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性,。
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能解析,,越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征,。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域,。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本,、提高生產(chǎn)力,、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間),。豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),,烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù),。
現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別,。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,,通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個(gè)空間,,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識(shí)別,。BDRhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理),。通過(guò)微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,,一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中,。這樣,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,,那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,,再加上一端PolyT的抓手,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù),。此外,,烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,,歡迎垂詢,。天津BD單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析,只要您需要,,烈冰提供全流程的無(wú)憂服務(wù),。scRNA單細(xì)胞
關(guān)于BDRhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類(lèi)型和樣本制備:在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液,、且細(xì)胞活力高(>70%),;此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要,。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BDRhapsody平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō),,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類(lèi)型而變化,。每種組織類(lèi)型都是獨(dú)特的,因此,,必須在開(kāi)始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),累積10+物種,、50+組織的消化protocol,,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助,。scRNA單細(xì)胞
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景,、信譽(yù)可靠、勵(lì)精圖治,、展望未來(lái)、有夢(mèng)想有目標(biāo),,有組織有體系的公司,,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來(lái)的道路上大放光明,攜手共畫(huà)藍(lán)圖,,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠(chéng)的客戶粉絲源,,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),,也希望未來(lái)公司能成為*****,,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**上海烈冰生物醫(yī)藥科技供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,,共創(chuàng)佳績(jī),一直以來(lái),,公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理,、創(chuàng)新發(fā)展、誠(chéng)實(shí)守信的方針,,員工精誠(chéng)努力,,協(xié)同奮取,以品質(zhì),、服務(wù)來(lái)贏得市場(chǎng),,我們一直在路上!