由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,,在平臺搭建前,,我們測試評估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上,。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數(shù)),。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,,來自每個細胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,,多重態(tài)發(fā)生率接近零,,并且在15000個細胞下小于5%。單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”,。溫州single cell 單細胞測序
針對BDRhapsody單細胞捕獲平臺,烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識:BDRhapsody試劑是轉(zhuǎn)為Rhapsody系統(tǒng)設(shè)計,,旦性能已得到驗證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學問題,,而不必花費時間應對多組學分析的技術(shù)障礙,。此外,我們還提基于BD平臺的單細胞多組學服務(wù),,如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細胞分析中得到充分研究,,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對生物學系統(tǒng)的理解。作為BD中國單細胞聯(lián)合實驗室的合作伙伴,,我們將繼續(xù)擴展檢測試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,,以支持前沿多組學分析。我們經(jīng)驗豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團隊可在多組學分析的各個方面為您提供幫助,。杭州single cell RNA單細胞服務(wù)機構(gòu)烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表,。
關(guān)于BDRhapsody單細胞平臺的樣本類型和樣本制備:在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊,獲得分離良好的細胞懸液,、且細胞活力高(>70%),;此外,了解您所研究細胞的大小范圍也很重要,。細胞大小通常與細胞表達的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān),。各種尺寸不同的細胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達解決方案中使用的BDRhapsody平臺兼容。一般來說,,細胞制備方案將根據(jù)組織來源和細胞類型而變化,。每種組織類型都是獨特的,因此,,必須在開始任何單細胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,累積10+物種,、50+組織的消化protocol,,若您的樣本為組織,,且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實驗上的幫助,。
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),,這些合在一起實現(xiàn)了細胞,、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要,。”為了推動科學發(fā)現(xiàn),,科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具,。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA,、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的,。BD平臺基于cyto-seq技術(shù),實現(xiàn)細胞和磁珠的一對一結(jié)合,。
烈冰生物在上海,、北京、廣州,、西安,、江西等多地部署單細胞測序?qū)嶒灲M中心,多地部署搭建BDRhapsody單細胞實驗平臺,,基于微孔的強大的高通量單細胞分析系統(tǒng),,為您提供可靠的單細胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標記系統(tǒng),,對高通量單細胞進行多組學的信息捕獲,,由此捕獲的信息科進一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達差異和表達豐度,。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),,精細區(qū)分上萬個細胞中mRNA的來源及表達豐度,。杭州single cell RNA單細胞服務(wù)機構(gòu)
十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物單細胞多組學領(lǐng)域的佼佼者,。溫州single cell 單細胞測序
什么時候要用到去死細胞的操作呢,?跟進烈冰生物多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看,當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作,。而太低活性的懸液(小于30%),,懸液中細胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),,失真嚴重,,建議重新收集樣本進行新的實驗,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性,。但需要注意到,,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時,,盡可能提供足量的細胞,,以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題,BDRhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低,,一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求,,特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。溫州single cell 單細胞測序
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