10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,，包含5000個被條形碼標記的點（barcodedspots）,，每個點的直徑為55μm，點和點之間中心的距離為100μm,，并且每個點都有一個barcode序列,。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,，然后進行文庫構建并進行測序,。根據數據的條形碼信息對數據進行分析，以確定哪些數據來自哪個位置,，從而實現空間基因表達的可視化,?；驕y序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，是下一個改變世界的技術,。成都烈冰科技空間轉錄組測序

作為2019年的明星技術之一,，10x Genomics單細胞測序憑借其高通量、低成本,、易操作,、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢一直保持著高熱度，目前利用該平臺發(fā)表的文章已達500多篇,?？臻g轉錄組技術優(yōu)勢：實現基因表達數據與空間定位信息的結合，解析多種類型組織切片樣本中基因表達譜,；無需組織解離,，保留組織結構及細胞微環(huán)境，鑒定異質性組織中細胞類型,，避免相關偏好性,；可用于挖掘新的組織生物標記物；可與現行實驗室組織分析方法輕松對接,，短時間內即可完成切片及文庫制備流程,。無錫BD Rhapsody空間轉錄組數據分析可視化烈冰空間轉錄組測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調控網絡特征。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,，深入解讀數據分析結果,，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷,、結果可視化,、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,，加速科研進程,！此外，烈冰生信團隊根據豐富的實戰(zhàn)經驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser）,，不僅可以將海量復雜的結果文件可視化,，還可以實現分析結果的三維立體化的展示呈現。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,！

空間轉錄組數據可以用單細胞轉錄組數據的分析策略進行分析，例如,，利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內的信號通路及其關鍵基因的較大情況,，揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內發(fā)生的生物學過程。針對任何一個基因,，空間轉錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布,；單細胞轉錄組可以給出該基因表達的細胞類群,；原位測序可以給出該基因在細胞內的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較,，可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異，給出其在細胞內的真實的演變狀況,?？臻g轉錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系，一度成為高通量測序技術的“天花板”,。

相比于常規(guī)的測序手段,，空間轉錄組測序有幾個明顯的優(yōu)勢：1.將轉錄組信息與空間信息對應，體現組織內部的異質性：每個區(qū)域獨特的條形碼使測序結果與空間位置形成一一對應關系,。雖然暫時還無法精細到單細胞層面,，但是這樣的區(qū)域劃分也已經足以展現出組織內部不同區(qū)域間的轉錄組差異。2.不影響對全組織進行分析：芯片上捕獲的全轉錄組在同一個反應中完成測序,，能有效降低多次重復實驗中的誤差,。測序結果如果不按照條形碼歸類，則直接體現的是切片全組織的轉錄組情況,，無需再做單獨檢測,。3.為進一步的研究提供指導意見：常規(guī)的轉錄組測序，對后續(xù)實驗的指導仍然停留在全組織層面,。而空間轉錄組測序則可以標識出更有價值的研究區(qū)域,，引導研究者將組織進一步細分?？臻g轉錄組測序以分子方式定義病理,，完成了病理數字化結合病理影像化的革新。無錫BD Rhapsody空間轉錄組技術支持

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單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組,、轉錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術,。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質性,。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,，而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息,。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,，將成為發(fā)育生物學,、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器,。成都烈冰科技空間轉錄組測序

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