RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度,、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá),,多維度地反映差異變化,;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動中的重要調(diào)控作用,;3)與蛋白組學(xué)研究相互補(bǔ)充,,多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ),,RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序?yàn)楸姸嗫蒲泻歪t(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段,。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺,。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù),包括樣本包埋,、貼片,、選片、HE染色,、拍照成像,、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗(yàn)證等各個(gè)步驟,,為您提供無憂服務(wù),。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機(jī)、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡,、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進(jìn)實(shí)驗(yàn)平臺,,并制定嚴(yán)格規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP,經(jīng)過大量的切片,、貼片實(shí)操演練,,對不同類型組織的切片厚度、溫度進(jìn)行優(yōu)化,,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片,。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,,準(zhǔn)確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,,判定空間區(qū)域內(nèi)的細(xì)胞類別,,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。蘇州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,,為從多維度揭示疾病進(jìn)展提供了強(qiáng)有力的工具,。
空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必耍性:研究單細(xì)胞是想要探究細(xì)胞間的異質(zhì)性,,但是常規(guī)的單細(xì)胞是將細(xì)胞解離成單細(xì)胞懸液,然后利用單細(xì)胞分離技術(shù)(微孔,,微板,,液滴)等方法實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞建庫,這里比較大的問題是是細(xì)胞失去了原本在組織的空間信息,。然而這個(gè)空間信息在實(shí)際研究中是非常重要,。特別是在研究細(xì)胞命運(yùn)機(jī)制及細(xì)胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發(fā)展空問轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的位置信息的保留,,對研究此類細(xì)胞狀態(tài)尤為必要,。
基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,,是國際上公認(rèn)的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn),。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進(jìn)行測定,,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),,足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,,所以又被稱為深度測序(deepsequencing),。基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,,可以說,,基因測序技術(shù)將是下一個(gè)改變世界的技術(shù),。烈冰對于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫測序分析,。
烈冰生物真正實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),、空間信息標(biāo)記,、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),,助力高分文章發(fā)表,;專業(yè)實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學(xué)團(tuán)隊(duì)提供個(gè)性化的產(chǎn)品應(yīng)用場景解讀,、保持對生物學(xué)意義的關(guān)注,;強(qiáng)大的生信分析團(tuán)隊(duì)一對一地進(jìn)行詳實(shí)科學(xué)的實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍,,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進(jìn)行OCT包埋,,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標(biāo)明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運(yùn)輸過程需要在低溫環(huán)境空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析,,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺,。西安烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
測序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異,、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問題,。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq,。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題,。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達(dá)解決方案是目前一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案,。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準(zhǔn)方法中,從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達(dá)情況,,同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息,。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
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