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重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-09-02

全基因組甲基化測(cè)序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,,對(duì)有參考基因組進(jìn)行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測(cè)序,是DNA甲基化檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”,。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關(guān)聯(lián)分析,、基因調(diào)控分析、疾病的甲基化標(biāo)志物篩選等探索性課題的研究,。技術(shù)優(yōu)勢(shì):DNA甲基化檢測(cè)**有力的工具,,單堿基分辨率,檢測(cè)每個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài),,全基因組范圍,,**限度地獲得甲基化信息,適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本,。甲基化驗(yàn)證是甲基化研究必不可少的一環(huán),。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富

WGBS:科學(xué)方案設(shè)計(jì):從項(xiàng)目背景了解,、協(xié)助方案設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)材料選取,、建庫測(cè)序,,到數(shù)據(jù)分析每個(gè)項(xiàng)目有特定的科學(xué)問題;需要專業(yè),、有價(jià)值的建議,;科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)及時(shí)高效的溝通,;以保障高質(zhì)量研究成果,。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>30ng/ul,;無RNA和蛋白污染建庫測(cè)序:測(cè)序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測(cè)序深度:>=30X,。信息分析:基于全基因組范圍的甲基化分析,,數(shù)據(jù)質(zhì)控,5mCCalling,,5mC在基因組,、染色體、功能元件上的分布,,多樣本甲基化差異聚類,,差異甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘,。安徽WGBSDNA甲基化口碑推薦ATAC-seq實(shí)驗(yàn)過程短,,從實(shí)驗(yàn)到分析可達(dá)2周。

DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNMT)催化下,,以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體,,將活性甲基轉(zhuǎn)移至DNA鏈中特定堿基上的化學(xué)修飾過程。哺乳動(dòng)物基因組中,,DNA甲基化多發(fā)生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子,。DNA甲基化是一種表觀(epigenetic)修飾,它在不改變DNA序列的情況下,,對(duì)個(gè)體的生長(zhǎng),、發(fā)育、基因表達(dá)模式以及基因組的穩(wěn)定性起到重要的調(diào)控作用,,這種修飾是可逆的,,并且這種修飾在發(fā)育和細(xì)胞增殖的過程中是可以穩(wěn)定傳遞的。近年來的大量研究表明,,DNA異常甲基化與**的發(fā)生,、發(fā)展、細(xì)胞*變有著密切的聯(lián)系。

industryTemplateRRBS用于人,、哺乳動(dòng)物及魚類方向的高水平甲基化研究,。

羥甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段,,然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,,快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域,??蓮V泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究。技術(shù)優(yōu)勢(shì):從項(xiàng)目背景了解,、協(xié)助方案設(shè)計(jì),、實(shí)驗(yàn)材料選取、建庫測(cè)序,,到數(shù)據(jù)分析每個(gè)項(xiàng)目有特定的科學(xué)問題,;需要專業(yè)、有價(jià)值的建議,;科學(xué),、縝密的設(shè)計(jì)及時(shí)高效的溝通;以保障高質(zhì)量研究成果強(qiáng)化版RRBS技術(shù)及應(yīng)用是高性價(jià)比方案,。四川RRBSDNA甲基化口碑推薦

中小樣本篩選, 大樣本中進(jìn)一步驗(yàn)證,。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富

甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,,然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,,快速、高效地尋找甲基化區(qū)域,??蓮V泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究。樣本要求:基因組DNA:>=3ug,;樣品濃度>50ng/ul,;無RNA和蛋白污染,建庫測(cè)序:測(cè)序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測(cè)序深度:20-30Mreads,。信息分析:基于全基因組范圍的羥甲基化分析,,數(shù)據(jù)質(zhì)控,Peak鋒Calling,,Peak鋒在基因組,、染色體、功能元件上的分布,,多樣本羥甲基化差異聚類,,差異羥甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,,結(jié)合項(xiàng)目背景和科學(xué)問題的數(shù)據(jù)亮點(diǎn)挖掘。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗(yàn)豐富