WGBS：科學方案設計：從項目背景了解,、協(xié)助方案設計,、實驗材料選取、建庫測序,，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學問題,；需要專業(yè)、有價值的建議,；科學,、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質(zhì)量研究成果,。樣本要求：基因組DNA:>=3ug,；樣品濃度>30ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150,；測序深度：>=30X,。信息分析：基于全基因組范圍的甲基化分析，數(shù)據(jù)質(zhì)控,，5mCCalling,，5mC在基因組,、染色體、功能元件上的分布,，多樣本甲基化差異聚類,，差異甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數(shù)據(jù)亮點挖掘,。ATAC-seq實驗過程短,，從實驗到分析可達2周。江蘇TAB-SeqDNA甲基化歡迎咨詢

羥甲基化DNA免疫沉淀測序（HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,，hMeDIP-Seq）是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段,，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速,、高效地尋找羥甲基化區(qū)域,。可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究,。樣本要求：基因組DNA:>=3ug,；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150;測序深度：20-30Mreads,。信息分析：基于全基因組范圍的羥甲基化分析,，數(shù)據(jù)質(zhì)控，Peak鋒Calling,，Peak鋒在基因組,、染色體、功能元件上的分布,，多樣本羥甲基化差異聚類,，差異羥甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數(shù)據(jù)亮點挖掘,。山東hMeDIP-SeqDNA甲基化方案芯片平臺作為目前比較成熟的篩選工具。

6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DN**段,，結合NGS測序技術在全基因組水平上分析6mA修飾信息,。6mA樣本要求：基因組DNA:>=5ug；樣品濃度>50ng/ul,；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150,；測序深度:20-30MReads。信息分析：基于全基因組范圍的6mA分析,，數(shù)據(jù)質(zhì)控,、Peak鋒Calling,Peak鋒在基因組、染色體,、功能元件上的分布,多樣本甲基化差異聚類,、DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數(shù)據(jù)亮點挖掘。

甲基化敏感性高分辨率熔解曲線分析(MS-HRM)：通過熔解曲線分析可以將單堿基序列的差異轉(zhuǎn)變成熔解曲線的差異,，因此DNA樣本經(jīng)過亞硫酸氫鹽處理后,，甲基化與未甲基化DNA會存在序列差異，這種差異可通過熔解曲線分析來發(fā)現(xiàn),。使用該方法進行甲基化分析*需一對引物,，相對簡單，不過這種方法對儀器的要求頗高,，需要帶HRM模塊的熒光定量PCR儀,，并且在進行實時定量PCR過程中，需要使用飽和的熒光染料,。利用MS-HRM技術進行甲基化檢測只能對檢測片段整體甲基化情況進行分析,，并不能明確每個CpG位點的甲基化狀態(tài)。因此這種技術適用于大量樣本的檢測,，篩選出感興趣的CPG位點,，然后利用其他方法進行單個位點的精確檢測及甲基化程度的精確定量。TBS具有高深度,、定量,、高準確性 。

DNA甲基化在**中的作用主要表現(xiàn)在以下幾個方面：一是甲基化的CpG島二核苷酸中的胞嘧啶以較高的頻率脫氨基變成胸腺嘧啶,，造成堿基突變,；二是抑*基因和DNA修復基因由于超甲基化而沉默；三是*基因甲基化水平降低而活化,；四是基因組總體甲基化水平降低使轉(zhuǎn)座子,、重復序列活化導致染色體穩(wěn)定性下降。這些因素是導致**發(fā)展,、轉(zhuǎn)移,、惡化**終導致患者死亡的重要原因。其中后三個方面源于甲基化水平的改變,，而甲基化的過程是可逆的,，因此可以甲基化位點為靶點，靶向用藥進行**的預防,、***,。WGBS技術及應用是有力方案。遼寧oxBSDNA甲基化經(jīng)驗豐富

全基因組甲基化分析及特異位點甲基化檢測,。江蘇TAB-SeqDNA甲基化歡迎咨詢

低甲基化,，原*基因***正常細胞中，由于甲基化作用原*基因多處于沉默狀態(tài),，但在多種**細胞中,，均發(fā)現(xiàn)原*基因處于低甲基化狀態(tài),，并且低甲基化狀態(tài)與其蛋白表達升高密切相關，表明低甲基化狀態(tài)可使原*基因***,。轉(zhuǎn)座子活化轉(zhuǎn)座子是可移動的基因序列,，包括LINE-1、HERV-K等,，在人類基因組中含量豐富,，正常情況下處于被甲基化狀態(tài)而轉(zhuǎn)錄沉默。而在**細胞中,，由于基因組總體甲基化水平的降低,，這些序列也因去甲基化而活化，轉(zhuǎn)移位置導致基因片段的插入和缺失,。江蘇TAB-SeqDNA甲基化歡迎咨詢