Chip-Seq 是指通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DN**段,，并對其進行純化和文庫構(gòu)建；然后對富集得到的DN**段進行高通量測序,，通過將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上,，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息,，是目前在全基因組水平研究蛋白結(jié)合靶DNA序列的重要手段,，為轉(zhuǎn)錄因子、組蛋白修飾,、核小體定位等表觀遺傳學(xué)的研究提供有效方法,。

應(yīng)用領(lǐng)域

1、確定組蛋白修飾的位置及其與基因表達的關(guān)系,。

2,、完成對轉(zhuǎn)錄因子及其它蛋白在基因組上結(jié)合位點的精細定位。

3,、研究特定的核小體或組蛋白的分布,。 通過甲基化數(shù)據(jù)，篩選疾病耐藥的差異甲基化,。江蘇cfDNA甲基化技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢

技術(shù)優(yōu)勢

1,、ChIP-Seq 能實現(xiàn)真正的全基因組分析。目前所能獲得的芯片上固定的探針只能**全基因組部分序列,，所獲得的雜交信息具有偏向性,。

2、對于結(jié)合位點分析,，ChIP-Seq 通過尋找“峰”,，結(jié)合分辨率可精確到10~30 bp，而芯片上探針由于長度所限,，無法精確定位,，即使目前比較高水平的商業(yè)芯片都無法提供可與ChIP-Seq 媲美的分辨率。

3,、是所需樣本數(shù)量,。ChIP-chip 需要多達4~5 μg?的起始樣本,，在雜交之前需要進行LM-PCR，但可能導(dǎo)致背景增高,，競爭性擴增等導(dǎo)致假陽性,。而ChIP-Seq *需要納克級起始材料，如SOLiD 起始材料可低至20ng,。 江蘇cfDNA甲基化技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢細胞,、全血、組織樣本干冰運輸,。

    甲基化DNA免疫沉淀測序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,，MeDIP-Seq）是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段，然后結(jié)合高通量測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,，快速,、高效地尋找甲基化區(qū)域?？蓮V泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究,。技術(shù)優(yōu)勢全基因組范圍鑒定甲基化修飾區(qū)域針對性檢測基因組內(nèi)具有甲基化修飾的區(qū)域與WGBS技術(shù)相比，成本更低科學(xué)方案設(shè)計從項目背景了解,、協(xié)助方案設(shè)計,、實驗材料選取、建庫測序,，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學(xué)問題,；需要專業(yè)、有價值的建議,；科學(xué),、縝密的設(shè)計及時高效的溝通；以保障高質(zhì)量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug,；樣品濃度>50ng/ul,；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。

    N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一,，在細菌,、藻類及植物基因組中***存在，在DNA錯配修復(fù),、染色體分離和毒力調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用,。6mA免疫沉淀測序(6mA-IPSeq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DN**段，然后結(jié)合高通量測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,，快速,、高效地尋找6mA甲基化區(qū)域。技術(shù)優(yōu)勢全基因組范圍鑒定6mA甲基化修飾區(qū)域技術(shù)方法適合所有物種(一般推薦藻類及植物)科學(xué)方案設(shè)計從項目背景了解,、協(xié)助方案設(shè)計,、實驗材料選取,、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學(xué)問題,；需要專業(yè),、有價值的建議；科學(xué),、縝密的設(shè)計及時高效的溝通,；以保障高質(zhì)量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul,；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150,。 CpG島常位于基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)附近。

    cfDNA,，cellfreeDNA,，就是血液中游離的自身DNA,，這些DNA多是從身體的細胞或者白血球破裂釋放出來的,，基本上都是無害的，不用多久會被自身清理掉,。不過值得一提的是,，當(dāng)孕婦懷孕的時候，胎兒的DNA也會同時釋放到母親的血液里頭去,，這是當(dāng)前火熱的無創(chuàng)唐氏篩查的基礎(chǔ),。通過抽取母親的外周血測序分析其中的游離DNA就可以判斷胎兒是否存在整個染色體或者大片段DNA的變異。有研究已經(jīng)證實,，**患者外周血中的cfDNA總量,，要高于健康人。通過這一點,，雖然不能武斷的說cfDNA能成為**標志物,，但是cfDNA的含量增多，能起到一個較好的提示作用,，作為一個初篩的手段,。基于cfDNA的液態(tài)活檢中,，盡管ctDNA在**診斷中的應(yīng)用是當(dāng)下cfDNA*****,，研究**深入的分支。但是,，cfDNA作為液態(tài)活檢,，不只是局限于**學(xué)。例如,，有研究報道對于接受***移植手術(shù)的病人,，可以通過監(jiān)測術(shù)后外周血中具有捐獻者基因特征,，片段化的cfDNA含量變化，來評估移植***的排斥情況,。 芯片數(shù)據(jù)如何與二代,、三代數(shù)據(jù)整合。江蘇cfDNA甲基化技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢

ATAC-seq實驗過程短,，從實驗到分析可達2周,。江蘇cfDNA甲基化技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢

    2019國自然基金解析—甲基化研究專題。從生命科學(xué)部和醫(yī)學(xué)科學(xué)部總體來看：2019年度,，生命科學(xué)部獲自然科學(xué)基金委批準資助6478項（不含杰出青年基金項目）,，批準資助金額共計，單項平均資助金額,。2019年度,，醫(yī)學(xué)科學(xué)部共批資助10138項（不含杰出青年基金項目），批準資助金額共計,，單項平均資助金額,。從甲基化研究方向來看，與甲基化研究相關(guān)的項目總數(shù)達283項,，項目總金額超過12669萬元,。其中生命科學(xué)部項目總數(shù)62項，項目金額3235萬元,，醫(yī)學(xué)科學(xué)部項目總數(shù)221項,，項目金額9434萬元。從2011-2019年甲基化研究方向的項目金額和項目數(shù)目分析,，整體呈上升趨勢,；從醫(yī)學(xué)科學(xué)部來看，甲基化研究項目獲批數(shù)量221項,，項目金額達到9434萬,，較之2018年度項目獲批金額（7166萬元）上升趨勢尤為明顯，可以看出,，甲基化研究日益成為國自然的研究熱點,。 江蘇cfDNA甲基化技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢