Real-time PCR鏈反應(yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題分析與解決方法:反應(yīng)緩沖液未完全融化或未充分混勻,。確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻,。引物特異性差,。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物,。引物量過(guò)多,。減少反應(yīng)體系中引物的用量,。模板量過(guò)多,。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,,而基因組DNA則應(yīng)<200ng,。外源DNA污染,。確保操作的潔凈。陰性對(duì)照出現(xiàn)條帶:試劑,,頭,,工作臺(tái)污染,。使用全新的試劑和頭,對(duì)工作臺(tái)進(jìn)行清潔,。條帶大小與理論不符:污染,。使用全新的試劑和頭,對(duì)工作臺(tái)進(jìn)行清潔,。模板或引物使用錯(cuò)誤,。更換引物和模板?;騺喰?。對(duì)研究的基因進(jìn)行序列分析和BLAST研究。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法,。蘇州細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟
聚合酶鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要防止RNA的降解,,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過(guò)程中,,注意避免mRNA的斷裂,;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對(duì)照,;內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量,。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動(dòng)蛋白)等,。其目的在于避免RNA定量誤差,、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺(tái)期,,出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長(zhǎng)度,、序列、二級(jí)結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān),。故對(duì)于每一個(gè)目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)的循環(huán)數(shù),,均應(yīng)通過(guò)單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來(lái)確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA,;在可能的情況下,,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性,。聚合酶鏈反應(yīng)可以選擇這些突變來(lái)理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。廈門(mén)組織RT-PCR檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是80年代中期發(fā)展起來(lái)的體外核酸擴(kuò)增技術(shù),。
Real-time PCR原理:基于探針的化學(xué)法,,Real-time PCR應(yīng)用一個(gè)或多個(gè)熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,;依賴(lài)熒光能量共振傳遞(FRET)檢測(cè)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,單單檢測(cè)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,,DNA及RNA定量,;基因表達(dá)驗(yàn)證;等位基因鑒別,;SNP分型,;病原體和病毒檢測(cè);多重PCR,,探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號(hào),,因此減少了背景熒光和假陽(yáng)性;探針可標(biāo)記不同波長(zhǎng)的熒光基團(tuán),,用于多重PCR反應(yīng),。對(duì)于不同的靶序列需要合成不同的探針,,原料成本較高,。
引物的設(shè)計(jì)對(duì)于這個(gè)實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要,因?yàn)镽eal-time PCR的檢測(cè)靈敏度比較高,,所以相應(yīng)的對(duì)引物設(shè)計(jì)的要求就很高,。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點(diǎn)必須注意:1,,引物的錯(cuò)配率(引物錯(cuò)配形成引物二聚體,,但是SYBR照樣能嵌入進(jìn)去,結(jié)果導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的誤差很大,,重復(fù)性也不好),。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,,引物同源性不高,,只要兩條產(chǎn)物的片段長(zhǎng)度相差足夠大,在電泳的時(shí)候能夠區(qū)分開(kāi)就可以,。Real-time PCR只有在熔解曲線的時(shí)候能分開(kāi),,所以這就造成整個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果誤差很大,不可信),。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中,。
Real-time PCR鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過(guò)減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性,。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR,。在個(gè)反應(yīng)中,一對(duì)引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,,除了預(yù)期的靶之外,,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成,。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,,并且位于其中的3’,。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長(zhǎng)DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識(shí),。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過(guò)重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù),。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)序列或突變的DN段,;這項(xiàng)技術(shù)可以創(chuàng)造特定的長(zhǎng)DNA構(gòu)建體,。它還可以將缺失、插入或點(diǎn)突變引入DNA序列,。如果基因的基因組DNA序列是已知的,,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來(lái)繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。廈門(mén)組織RT-PCR檢測(cè)技術(shù)技術(shù)服務(wù)
Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量,。蘇州細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟
Real-time PCR的染料法和探針?lè)ǖ倪x擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測(cè)定,,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過(guò)比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況,;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測(cè),,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針?lè)ㄖ饕獞?yīng)用于病毒RNA的檢測(cè),;以及單位點(diǎn)突變(SNP),;多基因的合并檢測(cè),探針?lè)ㄟ€可用于同一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測(cè)目的基因和內(nèi)參基因的情況,;而染料法則必須分管檢測(cè),。Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡(jiǎn)稱(chēng)Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的核酸定量技術(shù)。實(shí)時(shí)熒光定量在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),,利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,,使每一個(gè)循環(huán)變得“可見(jiàn)”,之后通過(guò)Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進(jìn)行定量的方法,。蘇州細(xì)胞PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟
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