Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR螢光染料,,SYBR螢光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,,發(fā)射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何螢光信號,,從而保證螢光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步,。此方法適用于:1,、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強到1000倍以上。2,、通用性好,不需要設(shè)計探針,方法簡便,省時,價格低廉,。3、通用型方法,,在國內(nèi)外科研中普遍使用,。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測,。5,、專一性要求不高的定量PCR檢測。聚合酶鏈式反應(yīng):模板的制備,,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA。徐州細胞Real-time PCR方案
聚合酶鏈式反應(yīng)的試驗污染:陽性對照,,在建立PCR反應(yīng)實驗室及一般的檢驗單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽性對照,,它是PCR反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志,。陽性對照要選擇擴增度中等,、重復(fù)性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標本,,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大,。因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定。徐州細胞Real-time PCR方案聚合酶鏈反應(yīng)應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器,。
Real-time PCR:所謂Real-time PCR技術(shù),,是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團,利用螢光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法,。利用螢光信號的變化實時檢測PCR擴增反應(yīng)中每一個循環(huán)擴增產(chǎn)物量的變化,,通過Ct值和標準曲線的分析對起始模板進行定量分析,。Real-time PCR技術(shù)即實時螢光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物監(jiān)測定量產(chǎn)生的偏差,提高實驗的重複性,。該技術(shù)已經(jīng)被普遍用于監(jiān)測細胞mRNA表達量的變化,;比較不同組織的mRNA表達差異;驗證基因晶片,,siRNA干擾的實驗結(jié)果,。
所謂real-timeQ-PCR技術(shù),,是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法,。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),,它能降解特異性熒光記探針,,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標記探針的運用使在一密閉的反應(yīng)管中能實時地監(jiān)測反應(yīng)全過程,。這兩個發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運用,。聚合酶鏈式反應(yīng)可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制。
Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標和引物,,內(nèi)標用基因工程方法合成,。上游引物用熒光標記,下游引物不標記,。在模板擴增的同時,,內(nèi)標也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,,由于內(nèi)標與靶模板的長度不同,,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,,以內(nèi)標為對照定量待檢測模板,。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標記),。多重連接依賴探針擴增允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制,。上海實時熒光定量PCR網(wǎng)站
聚合酶鏈式反應(yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,,可以是病原體標本如病毒、細菌,、菌類等,。徐州細胞Real-time PCR方案
內(nèi)標在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,,即PCR到達平臺期后進行檢測,,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差,。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實驗,,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量,。加入內(nèi)標后,,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性,。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量,、粗略定量的方法,。內(nèi)標對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標,,則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯,。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標,。也正是這個原因,,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標,但仍然只是一種半定量的方法,。徐州細胞Real-time PCR方案
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