Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內參照法:在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物,,內標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記,,下游引物不標記,。在模板擴增的同時,內標也被擴增,。在PCR產物中,,由于內標與靶模板的長度不同,,二者的擴增產物可用電泳或高效液相分離開來,,分別測定其熒光強度,以內標為對照定量待檢測模板,。2)競爭法:選擇由突變克隆產生的含有一個新內切位點的外源競爭性模板,。在同一反應管中,,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標記)。定量聚合酶鏈反應或者實時聚合酶鏈反應不要與逆轉錄允許估計樣品中存在的給定序列的量,。南京骨頭熒光PCR服務
Real-time PCR操作流程:1,、收集樣品。2相關試劑總RNA提取試劑TREzolReagent(RNA提取試劑),M-MLV(cDNA逆轉錄酶),RNA純化試劑,RealqPCRMasterMix(螢光定量PCR預混試劑),。3實驗儀器螢光定量PCR儀;PCR儀,;低溫離心機。4總RNA提取,。5cDNA合成在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA(1µg/µl),;Real-time PCR操作流程:2µl隨機引物(T18,10pmol/ul);2µl10mMdNTPmix,;加水至15µl體系,。混勻后70℃變性RNA5分鐘,,冰上速冷1分鐘,,離心將溶液收集至管底加入6µl5×PCRbuffer;1µlRNaseout,;1µlM-MLVRT,;加水至30µl體系。PCR儀中反應條件設定37℃延伸60min,,70℃保溫15min終止反應,。合成好的cDNA置于-20℃保存?zhèn)溆谩3V菅篟T-PCR檢測技術服務通過使用本產品,,可以在更短的時間內,,簡便、低成本地進行Real-time PCR檢測,。
Real-time PCR鏈式反應的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,,影響引物與模板特異性結合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補序列,,其PCR擴增是不會成功的,。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,,亮度更高,。引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,,擴增出的PCR產物為非目的性的序列,。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設計引物,。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶,。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,,Mg2+濃度過高,,退火溫度過低,循環(huán)次數過多引起,。其對策有:減少酶量,,或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度,。適當降低Mg2+濃度,。增加模板量,減少循環(huán)次數,。聚合酶鏈式反應準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,,分別來自兩種不同的噬熱菌。
聚合酶鏈式反應生物學研究的歷史中占據了重要的地位,。以此為基礎發(fā)展出包括Real-time PCR在內的多項應用技術,。自誕生后Real-time PCR技術持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴到整個PCR過程,,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感,、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴曲線的增長,。事實并非如此,,早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數據執(zhí)行數據分析工作,,而不是分析每個單獨的反應循環(huán),。對某些設備來說,必須向分析軟件提供實時的數據,,有些設備則不需要,。前一種設備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線,同時顯示在電腦屏幕上,。Real-time PCR技術已經被普遍用于監(jiān)測細胞mRNA表達量的變化,。
Real-time PCR鏈式反應的特點:靈敏度高:PCR產物的生成量是以指數方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平,。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞,;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位),;在細菌學中很小檢出率為3個細菌,。簡便、快速:PCR反應用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應,一般在2~4小時完成擴增反應,。擴增產物一般用電泳分析,,不一定要用同位素,無放射性污染,、易推廣,。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板,??芍苯佑门R床標本如血液、體腔液,、洗嗽液,、毛發(fā)、細胞,、活組織等DNA擴增檢測,。武漢微量Real-time PCR供應商聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,,所以相應的對引物設計的要求就很高,。莆田組織數字PCR設計公司
Real-time PCR在實驗過程中要防止RNA的降解。南京骨頭熒光PCR服務
引物的設計對于這個實驗至關重要,,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,,還有幾點必須注意:1,,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,,結果導致實驗結果的誤差很大,,重復性也不好)。2,,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,,引物同源性不高,只要兩條產物的片段長度相差足夠大,,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以,。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,,不可信),。南京骨頭熒光PCR服務
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