Real-time PCR雙熒光標(biāo)記探針設(shè)計(jì)原則:具體的其他要求可以具體聯(lián)系設(shè)計(jì)公司,,拿到合成好的引物,需要先確認(rèn)引物的性能,??梢杂眠@對(duì)引物先擴(kuò)增梯度稀釋后的標(biāo)準(zhǔn)品(標(biāo)準(zhǔn)品介紹見(jiàn)后續(xù)內(nèi)容)。由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品的加量和其對(duì)應(yīng)的Ct值,,描繪出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,。這里要注意根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認(rèn):1.決定系數(shù)R2大于0.98,,越接近于1,,結(jié)果越可靠。2.擴(kuò)增效率一般要求在0.8-1.2,,越接近于1,,越好。3.檢測(cè)的靈敏度,,必須確認(rèn),,通常要求35個(gè)循環(huán)以內(nèi),一般可以得到比較好的定量結(jié)果,,30個(gè)循環(huán)以內(nèi),,沒(méi)有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認(rèn)的,,通常要求30個(gè)循環(huán)內(nèi)沒(méi)有引物二聚體產(chǎn)生,。Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測(cè)。溫州細(xì)胞Real-time PCR供應(yīng)商
為了便于對(duì)所檢測(cè)樣本進(jìn)行比較,,在real-timeQ-PCR反應(yīng)的指數(shù)期,,首先需設(shè)定一定熒光信號(hào)的域值,一般這個(gè)域值(threshold)是以PCR反應(yīng)的前15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)作為熒光本底信號(hào)(baseline),,熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,。如果檢測(cè)到熒光信號(hào)超過(guò)域值被認(rèn)為是真正的信號(hào),它可用于定義樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct),。Ct值的含義是:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),。研究表明,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,,起始拷貝數(shù)越多,,Ct值越小,。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù),。莆田骨頭PCR檢測(cè)技術(shù)哪家好實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR引物設(shè)計(jì),PCR反應(yīng)中有兩條引物,,即5′端引物和3′引物,。設(shè)計(jì)引物時(shí)以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同,;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ),。引物設(shè)計(jì)的基本原則:引物長(zhǎng)度:15-30bp,常用為20bp左右,。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶,。ATGC很好隨機(jī)分布,,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。
Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待檢測(cè)的樣本中是否存在我們想要檢測(cè)的成分,,即待檢測(cè)成分有無(wú)的分析,。通常,定性分析可以應(yīng)用于病毒以及病原菌的檢測(cè),,物種鑒定以及基因分型等,。病毒及病原菌檢測(cè),如SARS,、H1N1病毒,,都可以通過(guò)Real-time PCR的方法進(jìn)行高靈敏度的檢測(cè),定性分析樣本是否已被病毒傳播,。物種鑒定如我們國(guó)家的一些檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu),,想要檢測(cè)進(jìn)口的牛肉制品中是否含有雞源、豬源或鴨源等成分,,或者用于檢測(cè)羊奶中是否會(huì)摻有牛奶等等,,可以通過(guò)Real-time PCR的方法進(jìn)行檢測(cè)?;蚍中?,如啤酒型,肥胖型基因的檢測(cè),,就是Real-time PCR在基因分型方面的應(yīng)用,。實(shí)時(shí)熒光定量PCR無(wú)需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的,。
Real-time PCR:Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知樣品進(jìn)行定量測(cè)定,,因此,,實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的,、值得信賴的科學(xué)方法,。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實(shí)時(shí)熒光定量PCR是迄今為止定量較準(zhǔn)確,重現(xiàn)性較好的定量方法,,已得到全世界的公認(rèn),,普遍用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,,藥物療效考核,、病原體檢測(cè)等諸多領(lǐng)域。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的定量方法,,在Real-time PCR中,,模板定量有兩種策略,相對(duì)定量和定量,。Real-time PCR提高實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性,。溫州細(xì)胞Real-time PCR供應(yīng)商
所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),。溫州細(xì)胞Real-time PCR供應(yīng)商
Real-time PCR實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均應(yīng)在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長(zhǎng)時(shí)間,。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機(jī)玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用),。3.有機(jī)玻璃的電泳槽等,,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,,乙醇干燥,,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,,晾干,。4.配制的溶液應(yīng)盡可能的用0.1%DEPC,在37℃處理12hr以上,。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC,。不能高壓滅菌的試劑,應(yīng)當(dāng)用DEPC處理過(guò)的無(wú)菌雙蒸水配制,,然后經(jīng)0.22μm濾膜過(guò)濾除菌,。5.操作人員戴一次性口罩、帽子,、手套,,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中手套要勤換,。6.設(shè)置RNA操作專業(yè)使用實(shí)驗(yàn)室,所有器械等應(yīng)為專業(yè)使用,。溫州細(xì)胞Real-time PCR供應(yīng)商
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