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珠海組織RT-PCR檢測技術原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2023-07-28

實時定量PCR的系統(tǒng)構成及工作原理:熒光定量檢測系統(tǒng)由實時熒光定量PCR儀,,實時熒光定量試劑,,通用電腦,自動分析軟件等構成,。設備由熒光定量系統(tǒng)和計算機組成,用來監(jiān)測循環(huán)過程的熒光,。與實時設備相連的計算機收集熒光數(shù)據(jù),。數(shù)據(jù)通過開發(fā)的實時分析軟件以圖表的形式顯示,。原始數(shù)據(jù)被繪制成熒光強度相對于循環(huán)數(shù)的圖表。原始數(shù)據(jù)收集后可以開始分析,。實時設備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進行正?;幚韥韽浹a背景熒光的差異。正?;罂梢栽O定域值水平,,這就是分析熒光數(shù)據(jù)的水平。實時定量PCR通用電腦,,自動分析軟件等構成,。珠海組織RT-PCR檢測技術原理及步驟

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Real-time PCR鏈式反應:每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,,而且價格昂貴,,制約了PCR技術的應用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對于PCR的應用有里程碑的意義,,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術變得非常簡捷,、同時也降低了成本,,PCR技術得以大量應用,并逐步應用于臨床,。多重連接依賴探針擴增允許用單個引物對擴增多個靶標,,從而避免多重PCR的分辨率限制。引物的設計注意事項:1,,注意引物設計好后的產物長度,。Real-time PCR的較佳產物長度在150-250kb左右(書上說這樣可以增加熒光的敏感度,減少實驗誤差,,但是我對這個說法持懷疑態(tài)度,。產物長度越大,SYBR嵌入的越多,,這樣才能夠保證之后的熒光值比較可信),。2,不同的管家基因擴增效率不同,。所以在做整個實驗之前應該做一次檢測擴增效率的實驗,。如果擴增效率相差太大,就不能使用delt,,deltCt法來比較基因表達量的高低,。蘇州實時PCR檢測技術原理PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的螢光探針。

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Real-time PCR相對定量中的標準曲線法如何進行:主要是相對定量標準品的制作,,一般有三種方法:1,、比較復雜的方法:質粒,,采用Biotnt提供內參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進行Real-time PCR實驗,,得到PCR擴增產物,;PCR擴增產物轉入質粒中,得到相對定量的標準品,;2,、一般采用的方法1:比較強的CDNA模板,3,、一般采用的方法:PCR擴增產物,,如果在方法2中找不到比較強的CDNA模板,則選用PCR產物作為相對定量的標準品也是可以的,;需要注意的事項是:PCR產物濃度很高,,而Real-time PCR的產物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR污染,,要注意操作,。

Real-time PCR鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性,。在總RNA的提取過程中,,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,,必須設陰性對照,;內參的設定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶),、β-Actin(β-肌動蛋白)等,。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差,;PCR不能進入平臺期,,出現(xiàn)平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列,、二級結構以及目標DNA起始的數(shù)量有關,。故對于每一個目標序列出現(xiàn)平臺效應的循環(huán)數(shù),均應通過單獨實驗來確定,;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA,;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,,以消除基因和mRNA的共線性,。基于探針的化學法,Real-time PCR應用一個或多個熒光標記的寡核苷酸探針檢測PCR擴增產物,。

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為了便于對所檢測樣本進行比較,,在real-timeQ-PCR反應的指數(shù)期,首先需設定一定熒光信號的域值,,一般這個域值(threshold)是以PCR反應的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號(baseline),熒光域值的缺省設置是3~15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍,。如果檢測到熒光信號超過域值被認為是真正的信號,,它可用于定義樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個反應管內的熒光信號達到設定的域值時所經歷的循環(huán)數(shù),。研究表明,,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關系,起始拷貝數(shù)越多,,Ct值越小,。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可作出標準曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù),。Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析。連云港分子生物學RT-PCR檢測技術原理

Real-time PCR的基本目標是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸,。珠海組織RT-PCR檢測技術原理及步驟

實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR技術有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,,通過對每個樣品Ct值的計算,,根據(jù)標準曲線獲得定量結果。因此,,實時熒光定量PCR無需內標是建立在兩個基礎之上的:Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,,因此Ct值的重現(xiàn)性極好,,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內擴增,得到的Ct值是恒定的,。珠海組織RT-PCR檢測技術原理及步驟

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