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Real-time PCR反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),,從而避免多重PCR的分辨率限制,。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個(gè)PCR混合物中的多個(gè)引物組組成,以產(chǎn)生對(duì)不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子,。通過同時(shí)靶向多個(gè)基因,,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時(shí)間來執(zhí)行,。每個(gè)引物組的退火溫度必須優(yōu)化,,以在單個(gè)反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸,。也就是說,,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時(shí),它們的堿基對(duì)長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶,。在PCR產(chǎn)物中,,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同。連云港細(xì)胞RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,,但令人腦袋不適的問題是易污染,,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,,或標(biāo)本放置時(shí),,由于密封不嚴(yán)溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染,;標(biāo)本核酸模板在提取過程中,,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,,導(dǎo)致彼此間的污染,。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣,、容器,、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置,。廈門特殊樣本熒光定量PCR研究方案所謂Real-time PCR技術(shù),,是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團(tuán),。
Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào),,同一次反應(yīng)中針對(duì)不同的基因需單獨(dú)設(shè)置基線。閾值(threshold):自動(dòng)設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,。手動(dòng)設(shè)置:置于指數(shù)擴(kuò)增期,,剛好可以清楚地看到熒光信號(hào)明顯增強(qiáng)。同一次反應(yīng)中針對(duì)不同的基因可單獨(dú)設(shè)置閾值,,但對(duì)于同一個(gè)基因擴(kuò)增一定要用同一個(gè)閾值,。Ct值:與起始濃度的對(duì)數(shù)成線性關(guān)系,分析定量時(shí)候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會(huì)導(dǎo)致定量的不準(zhǔn)確,。相對(duì)定量:通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計(jì)算基因之間的表達(dá)差異,一般是2-△△Ct,。或者是考慮擴(kuò)增效率的Pfaffl法,。
Real-time PCR探針法適用于:1,、具有高適應(yīng)性和可靠性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好,,特異性更高,。2、適用于擴(kuò)增序列專一的體系的檢測,。3,、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。4,、靶基因的特異序列較短,,無論怎樣較佳化引物設(shè)計(jì)條件都不能解決。5,、存在與靶基因同源的序列,,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,對(duì)特異性要求較高的定量,。6,、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動(dòng)物病原體基因的檢測,畜禽產(chǎn)品的檢驗(yàn)檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針法:PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的螢光探針,,該探針為一寡核苷酸,,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告螢光基團(tuán)和一個(gè)淬滅螢光基團(tuán)。探針完整時(shí),,報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的螢光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收,;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,,使報(bào)告螢光基團(tuán)和淬滅螢光基團(tuán)分離,,從而螢光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到螢光信號(hào),,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)螢光分子形成,,實(shí)現(xiàn)了螢光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步,。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法,。
Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì),,然后通過熒光化學(xué)物質(zhì)監(jiān)測每次PCR反應(yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,之后通過內(nèi)參法或外參法對(duì)待測樣品中的特定DNA序列(目的基因)進(jìn)行定量分析的方法,。實(shí)驗(yàn)過程中,,這些熒光物質(zhì)可以在激發(fā)光的作用下釋放出一定波長的發(fā)射光,定量用PCR儀通過對(duì)這些發(fā)射光進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測,,較終可以描繪出整個(gè)PCR的反應(yīng)過程,,這就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng):DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑,。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子拷貝,。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),,DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈,。因此,,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物,,DNA聚合酶,、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。但是,,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活,。Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)過程中為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對(duì)照,。寧波組織熒光定量PCR哪家好
實(shí)時(shí)熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的,。連云港細(xì)胞RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
實(shí)時(shí)定量PCR的系統(tǒng)構(gòu)成及工作原理:熒光定量檢測系統(tǒng)由實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,實(shí)時(shí)熒光定量試劑,,通用電腦,,自動(dòng)分析軟件等構(gòu)成。設(shè)備由熒光定量系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)組成,,用來監(jiān)測循環(huán)過程的熒光,。與實(shí)時(shí)設(shè)備相連的計(jì)算機(jī)收集熒光數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)通過開發(fā)的實(shí)時(shí)分析軟件以圖表的形式顯示。原始數(shù)據(jù)被繪制成熒光強(qiáng)度相對(duì)于循環(huán)數(shù)的圖表,。原始數(shù)據(jù)收集后可以開始分析,。實(shí)時(shí)設(shè)備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行正常化處理來彌補(bǔ)背景熒光的差異,。正?;罂梢栽O(shè)定域值水平,這就是分析熒光數(shù)據(jù)的水平,。連云港細(xì)胞RT-PCR檢測技術(shù)哪家好
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