聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點(diǎn):靈敏度高:PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,,能將皮克(pg=10-12)量級(jí)的起始待測模板擴(kuò)增到微克(μg=-6)水平,。能從100萬個(gè)細(xì)胞中檢出一個(gè)靶細(xì)胞;在病毒的檢測中,,PCR的靈敏度可達(dá)3個(gè)RFU(空斑形成單位),;在細(xì)菌學(xué)中很小檢出率為3個(gè)細(xì)菌。簡便,、快速:PCR反應(yīng)用耐高溫的Taq DNA聚合酶,,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴(kuò)增液和水浴鍋上進(jìn)行變性-退火-延伸反應(yīng),,一般在2~4 小時(shí)完成擴(kuò)增反應(yīng),。擴(kuò)增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,,無放射性污染,、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細(xì)菌及培養(yǎng)細(xì)胞,,DNA 粗制品及RNA均可作為擴(kuò)增模板,。可直接用臨床標(biāo)本如血液,、體腔液,、洗嗽液、毛發(fā),、細(xì)胞,、活組織等DNA擴(kuò)增檢測?,F(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時(shí)間內(nèi)復(fù)制完成,。南通骨頭RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:10×擴(kuò)增緩沖液,、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度),、模板DNA,、Taq DNA聚合酶、Mg2+(終濃度),、補(bǔ)加雙蒸水等,。其中dNTP、引物,、模板DNA,、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實(shí)驗(yàn)調(diào)整,以上表格只提供大致參考值,。PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,,細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物為一段RNA鏈)、酶,、dNTP,、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設(shè)計(jì)方法,,由PCR在實(shí)驗(yàn)中的目的決定,,但基本原則相同。南通骨頭RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻,。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):定量PCR允許實(shí)時(shí)定量和檢測特定的DNA序列,,因?yàn)樗诤铣蛇^程中測量濃度。有兩種方法可以同時(shí)檢測和定量,。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料,。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標(biāo)記的探針。只有在探針與其互補(bǔ)DNA雜交后,,才能使用這些方法檢測DNA,。一種有趣的技術(shù)組合是實(shí)時(shí)PCR和逆轉(zhuǎn)錄。這種復(fù)雜的技術(shù)被稱為RT-qPCR,,允許定量少量RNA,。通過這種組合技術(shù),mRNA被轉(zhuǎn)化為cDNA,,并用qPCR進(jìn)一步定量,。這種技術(shù)降低了聚合酶鏈反應(yīng)終點(diǎn)出錯(cuò)的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關(guān)的基因的機(jī)會(huì),。實(shí)驗(yàn)室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調(diào)控,。
聚合酶鏈反應(yīng):熱啟動(dòng)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):一種在PCR的初始建立階段減少非特異性擴(kuò)增的技術(shù),。它可以通過將反應(yīng)組分加熱到變性溫度(例如95 c)在加入聚合酶。[36]已經(jīng)開發(fā)了特殊的酶系統(tǒng),,通過結(jié)合抗體來抑制聚合酶在環(huán)境溫度下的活性[37][37]或者通過共價(jià)鍵結(jié)合的抑制劑的存在,,該抑制劑在高溫活化步驟后解離。熱啟動(dòng)/冷完成聚合酶鏈反應(yīng)是通過新的雜合聚合酶實(shí)現(xiàn)的,,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍,,在伸長溫度下立即。序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)(ISSR):一種用于DNA指紋識(shí)別的聚合酶鏈反應(yīng)方法,,它放大簡單重復(fù)序列之間的區(qū)域,以產(chǎn)生擴(kuò)增片段長度的獨(dú)特指紋,。電子聚合酶鏈反應(yīng)(數(shù)字聚合酶鏈反應(yīng),、虛擬聚合酶鏈反應(yīng)、電子聚合酶鏈反應(yīng),、電子聚合酶鏈反應(yīng))是指計(jì)算工具使用給定的一組引物 ( 探針)來擴(kuò)增來自測序的基因組或轉(zhuǎn)錄組的DNA 序列,,用于計(jì)算理論聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)果。電子PCR被提出作為分子生物學(xué)的教育工具,。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,。
現(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時(shí)間內(nèi)復(fù)制完成,,因此可以改為兩步法,,即退火和延伸同時(shí)在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,,提高了反應(yīng)速度,。檢測:PCR反應(yīng)擴(kuò)增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測就成了關(guān)鍵,。熒光素(溴化乙錠,,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測手段。電泳法檢測特異性是不太高的,,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判,。但因?yàn)槠浜喗菀仔校蔀榱酥髁鳈z測方法,。近年來以熒光探針為的檢測方法,,有逐漸取代電泳法的趨勢。序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)放大簡單重復(fù)序列之間的區(qū)域,,以產(chǎn)生擴(kuò)增片段長度的獨(dú)特指紋,。深圳血液定量PCR技術(shù)服務(wù)
重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)可以將缺失、插入或點(diǎn)突變引入DNA序列,。南通骨頭RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟
聚合酶鏈?zhǔn)剑篜CR由變性--退火--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備,;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合,;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,,靶序列為模板,,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2-4分鐘,,2-3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍,。到達(dá)平臺(tái)期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝?!CR技術(shù)敏感性高,,特異性強(qiáng),操作簡便,、快速,,在生命科學(xué)研究、食品衛(wèi)生,、醫(yī)療,、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān)測等諸多方面都具有重要的應(yīng)用價(jià)值。南通骨頭RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟