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南通微量RT-PCR檢測技術服務

來源: 發(fā)布時間:2022-01-19

聚合酶鏈式反應的常見問題:陰性:需注意的是有時忘加Taq酶或溴乙錠。引物:引物質量,、引物的濃度,、兩條引物的濃度是否對稱,是PCR失敗或擴增條帶不理想,、容易彌散的常見原因,。有些批號的引物合成質量有問題,兩條引物一條濃度高,,一條濃度低,,造成低效率的不對稱擴增,對策為:選定一個好的引物合成單位,。引物的濃度不但要看OD值,更要注重引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,,一定要有引物條帶出現(xiàn),,而且兩引物帶的亮度應大體一致,如一條引物有條帶,,一條引物無條帶,,此時做PCR有可能失敗,應和引物合成單位協(xié)商解決,。如一條引物亮度高,,一條亮度低,在稀釋引物時要平衡其濃度,。引物應高濃度小量分裝保存,,防止多次凍融或長期放冰箱冷藏部分,導致引物變質降解失效,。引物設計不合理,,如引物長度不夠,引物之間形成二聚體等,。聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學技術,。南通微量RT-PCR檢測技術服務

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聚合酶鏈式反應:模板的制備,PCR的模板可以是DNA,,也可以是RNA,。模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,,可以是病原體標本如病毒、細菌,、菌類等,。也可以是病理生理標本如細胞、血液,、羊水細胞等,。法醫(yī)學標本有血斑、精斑,、毛發(fā)等,。標本處理的基本要求是除去雜質,并部分純化標本中的核酸,。多數(shù)樣品需要經(jīng)過SDS和蛋白酶K處理,。難以破碎的細菌,可用溶菌酶加EDTA處理,。所得到的粗制DNA,,經(jīng)酚、氯仿抽提純化,,再用乙醇沉淀后用作PCR反應模板,。南通微量RT-PCR檢測技術服務聚合酶鏈反應很容易理解和使用,并迅速產(chǎn)生結果,。

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聚合酶鏈式反應的常見問題:靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,,導致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:操作時應小心輕柔,,防止將靶序列吸入加樣內或濺出離心管外,。除酶及不能耐高溫的物質外,所有試劑或器材均應高壓消毒,。所用離心管及樣進頭等均應一次性使用,。必要時,在加標本前,,反應管和試劑用紫外線照射,,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,,這些小片段比靶序列短,,但有一定的同源性??苫ハ嗥唇?,與引物互補后,可擴增出PCR產(chǎn)物,,而導致假陽性的產(chǎn)生,,可用巢式PCR方法來減輕或消除,。

聚合酶鏈式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度),、引物(終濃度),、模板DNA、Taq DNA聚合酶,、Mg2+(終濃度),、補加雙蒸水等。其中dNTP,、引物,、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調整,,以上表格只提供大致參考值,。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內DNA復制的引物為一段RNA鏈),、酶,、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+),。引物有多種設計方法,,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同,。電子聚合酶鏈反應用于計算理論聚合酶鏈反應結果,。

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聚合酶鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性,。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂,;為了防止非特異性擴增,,必須設陰性對照;內參的設定:主要為了用于靶RNA的定量,。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶),、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差,、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差,;PCR不能進入平臺期,出現(xiàn)平臺效應與所擴增的目的基因的長度,、序列,、二級結構以及目標DNA起始的數(shù)量有關。故對于每一個目標序列出現(xiàn)平臺效應的循環(huán)數(shù),,均應通過單獨實驗來確定,;防止DNA的污染: 采用DNA酶處理RNA,; 在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,,以消除基因和mRNA的共線性,。嵌套聚合酶鏈反應的兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。南通微量RT-PCR檢測技術服務

聚合酶鏈反應具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點,。南通微量RT-PCR檢測技術服務

聚合酶鏈反應允許快速生產(chǎn)短DN段,,即使已知的引物序列不超過兩個。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法,,例如生成雜交 探針用于 Southern 或northern blot 雜交,。聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA,有時是單鏈的,,甚至可以從非常少量的起始材料中進行分析,。脫氧核糖核酸測序的任務也可以通過聚合酶鏈反應來輔助完成。已知的DN段可以很容易地從患有遺傳疾病突變的患者體內產(chǎn)生,。對擴增技術的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段,,或者可以產(chǎn)生感興趣區(qū)域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統(tǒng)的 DNA克隆,。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體,,這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”,,它還可以分析或提取已經(jīng)插入載體的片段,。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產(chǎn)生突變(通用的或定點的)插入片段。南通微量RT-PCR檢測技術服務