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靜安區(qū)哪里有二代測序技術(shù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-12-11

不同二代測序技術(shù)平臺(tái)的速度

Illumina 測序平臺(tái):這是目前市場上應(yīng)用較為***的二代測序平臺(tái)之一,,其測序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,,一次運(yùn)行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),,通量可達(dá)數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長,能夠滿足大規(guī)?;蚪M學(xué)研究和臨床檢測的需求,。

Roche 454 測序平臺(tái):Roche 454 測序系統(tǒng)的測序速度也較快,其特點(diǎn)是測序片段比較長,,高質(zhì)量的讀長能達(dá)到 400bp 左右,,一次運(yùn)行可以在 24 小時(shí)左右完成對(duì)一定數(shù)量樣本的測序。

BGISEQ 系列:華大智造的 BGISEQ 系列測序儀在速度上也有出色表現(xiàn),,如全球二代測序速度**快設(shè)備 E25 量產(chǎn),,為快速測序提供了有力支持 什么是二代測序技術(shù)?靜安區(qū)哪里有二代測序技術(shù)

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二代測序的建庫步驟⑤

五,、文庫富集(可選步驟)

PCR富集:對(duì)于一些起始樣本量較少或者連接效率較低的情況,,可能需要進(jìn)行PCR富集。利用與接頭序列互補(bǔ)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,,增加文庫中目標(biāo)DNA片段的數(shù)量,。在PCR反應(yīng)中,需要注意引物的設(shè)計(jì)要與接頭序列準(zhǔn)確匹配,,并且要優(yōu)化PCR循環(huán)數(shù),,避免過度擴(kuò)增導(dǎo)致文庫多樣性降低或引入PCR偏差。一般會(huì)通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定合適的PCR循環(huán)數(shù),,例如從10-15個(gè)循環(huán)開始嘗試,,通過檢測擴(kuò)增產(chǎn)物的量和質(zhì)量來調(diào)整循環(huán)數(shù),。 二代測序技術(shù)二代測序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)。

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一代,、二代,、三代測序的技術(shù)原理和技術(shù)特點(diǎn)分別是什么,?

技術(shù)原理:

一代—雙脫氧終止法

二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像

三代—PacBio SMRT測序技術(shù)

技術(shù)特點(diǎn):

一代—只能檢測序列一致的PCR產(chǎn)物,;讀長可以較長,比如Sanger可以達(dá)到幾百bp,;通量低,,一次只能檢測少量的序列;成本低,;

二代—可以并行測序,;需要放大信號(hào)才能檢測;通量大,,可以產(chǎn)生上G的reads,;讀長較短,一-般是固定的,,比如50,、100、150,、250等,;成本較高

三代:可以并行測序;不需要放大信號(hào),,對(duì)單個(gè)分子進(jìn)行測序,;通量大,比如SequelII平臺(tái),,一張芯片可以有800萬個(gè)ZMW,;讀長較長;測序精確度較差,;成本高,;

二代測序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些?

基因組學(xué)研究:用于全基因組測序,,快速獲取物種的基因組序列信息,,研究基因組結(jié)構(gòu)、變異,、進(jìn)化等,;進(jìn)行全外顯子組測序,重點(diǎn)關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:通過對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序,,可分析基因的表達(dá)水平、可變剪接,、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等,,有助于深入了解基因在不同生理和病理狀態(tài)下的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。

疾病診斷與***:在遺傳病診斷中,,能夠檢測出導(dǎo)致遺傳病的基因突變,,為疾病的診斷、遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷提供依據(jù),;在**研究中,,可分析腫瘤細(xì)胞的基因突變、拷貝數(shù)變異,、基因融合等,,為**的早期診斷、靶向***和預(yù)后評(píng)估提供支持,。

藥物研發(fā):用于藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證,,通過分析疾病相關(guān)的基因變異和表達(dá)變化,確定潛在的藥物作用靶點(diǎn),;還可進(jìn)行藥物基因組學(xué)研究,,預(yù)測患者對(duì)藥物的反應(yīng)和不良反應(yīng),實(shí)現(xiàn)個(gè)體化藥物***,。

微生物學(xué)研究:對(duì)微生物群落進(jìn)行宏基因組測序,,無需培養(yǎng)即可分析微生物的種類、豐度和功能基因,,了解微生物群落的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)變化,,研究微生物與宿主的相互作用,以及在環(huán)境科學(xué),、農(nóng)業(yè),、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用


二代測序的優(yōu)勢(shì)是高靈敏度。

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二代測序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異②

遺傳病患者及攜帶者

優(yōu)勢(shì):在常見單基因遺傳病如囊性纖維化,、鐮狀細(xì)胞貧血等的檢測中,,二代測序技術(shù)準(zhǔn)確性高,能夠快速,、準(zhǔn)確地找到致病基因,,對(duì)于有家族遺傳病史的人群,可有效確定是否攜帶致病基因,,評(píng)估生育患病后代的風(fēng)險(xiǎn),。

局限性:對(duì)于罕見遺傳病,由于基因突變的多樣性和復(fù)雜性,,可能存在部分致病基因未被覆蓋或難以準(zhǔn)確解讀的情況,,導(dǎo)致準(zhǔn)確性有所降低,。此外,即使檢測結(jié)果為陰性,,也不能完全排除患病可能,,因部分遺傳病可能由未知基因突變或基因與環(huán)境相互作用引起2 二代測序可以應(yīng)用在哪些方面?山東哪里有二代測序流程

二代測序需要分析嗎,?靜安區(qū)哪里有二代測序技術(shù)

一代,、二代、三代測序的區(qū)別分別是什么,?

一代測序是上世紀(jì)70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,,也稱為Sanger測序,。

二代測序技術(shù)(NGS)是為了改進(jìn)一代測序通量過低的問題而出現(xiàn)的,,能夠同時(shí)對(duì)上百萬甚至數(shù)十億個(gè)DNA分子進(jìn)行測序?qū)崿F(xiàn)了大規(guī)模、高通量測序的目標(biāo),。

三代測序主要有兩種技術(shù)PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測序技術(shù),,這兩種技術(shù)的測序讀長都可以達(dá)到幾-kb的級(jí)別,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測序技術(shù),。 靜安區(qū)哪里有二代測序技術(shù)

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標(biāo)簽: 二代測序