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微生物基因組——數據組裝后的分析步驟 基因預測：利用軟件如Prokka等進行基因預測,。這些軟件會根據微生物基因組的序列特征,，識別出可能的基因區(qū)域,。例如,，通過尋找開放閱讀框（ORF）來確定基因的位置和范圍。對于細菌基因組,，由于其基因結構相對簡單,，基因預...

二代測序的建庫步驟①樣本準備樣本采集：根據研究目的采**適的樣本，如血液,、組織,、細胞等。例如,，在**研究中,，可能會采集**組織和對應的正常組織。對于血液樣本,，一般采用靜脈穿刺采集外周血,，收集在含有抗凝劑（如EDTA）的**管中，以防止血液凝固,。組織樣本則需要在...

常見的二代測序類型① 全基因組測序（WGS）：對生物體整個基因組進行測序,，涵蓋所有基因、非編碼區(qū)域,、調控區(qū)域等,。能***檢測基因組變異，但數據量和成本較高,，適用于復雜疾病研究,、物種進化分析等. 全外顯子組測序（WES）：針對基因組中全部外顯子區(qū)...

二代測序的優(yōu)勢和劣勢有哪些？優(yōu)勢：能夠同時得到大量的序列數據,，相比于一代測序技術,，通量提高了成千上萬倍;單條序列成本非常低廉。劣勢：序列讀長較短,，Illumina平臺為250-300bp,，454平臺也只有500bp左右;由于建庫中利用了PCR富集序列，因此有一...

WES測序 WES測序即全外顯子組測序,，是基于二代測序技術的新型基因檢測方法,，以下是具體介紹： 原理 人類基因組中*1%-5%的外顯子區(qū)域編碼蛋白質，卻包含約85%的致病變異。WES測序通過序列捕獲技術富集外顯子區(qū)域DNA,，再利用高通量測...

WES測序應用領域 遺傳性疾病的診斷和研究：適用于具有遺傳病家族史、發(fā)育遲緩,、智力障礙,、自閉癥、先天性畸形等癥狀的患者,，以及經過相應疾病panel檢測結果為陰性,、需要更大范圍尋找可能遺傳病因的患者等?？梢园l(fā)現與遺傳病相關的基因突變和變異,，為遺傳病的診...

什么是chip-seq？ Chip-seq即染色質免疫共沉淀測序（ChromatinImmunoprecipitationSequencing）,，是一種結合染色質免疫共沉淀（ChIP）技術與高通量測序（NGS）的分子生物學技術,，可在全基因組范圍內檢測...

什么樣本可以做二代測序？① 1,、血液樣本 全血：這是最常見的樣本類型之一,。血液中含有白細胞，其細胞核內有完整的基因組DNA,。通過提取白細胞中的DNA,，可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等,。例如,，在遺傳病的基因診斷中，抽取患者的全血,，提取DNA...

二代測序的建庫步驟②二,、片段化處理物理方法：超聲破碎是常用的物理片段化方法。它通過超聲波的高頻振動將核酸分子打斷成合適大小的片段,。例如,，在一些文庫構建中，將DNA樣本置于超聲破碎儀中,，通過調整超聲功率和時間,，可以將DNA片段化到幾百堿基對（bp）的長度范圍，一...

二代測序——轉錄組測序的實驗流程（下）測序根據研究需求和預算選擇合適的測序平臺,，如Illumina測序平臺,。它的測序原理主要是邊合成邊測序（SBS）。在測序過程中,，dNTP（脫氧核糖核苷三磷酸）帶有不同顏色的熒光標記,，當新的dNTP加入到正在合成的DNA鏈時，...

二代測序在代謝組研究中的應用途徑② 調控元件測序輔助代謝組分析 原理：除了對編碼基因的轉錄組測序外，二代測序還可用于分析非編碼RNA（如miRNA,、lncRNA等）以及基因的調控元件（如啟動子,、增強子等）。miRNA可以通過與靶mRNA結合抑制...

一代,、二代,、三代測序的技術原理和技術特點分別是什么？ 技術原理： 一代—雙脫氧終止法 二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像 三代—PacBio SMRT測序技術 技術特點： 一代—只能檢測序列一致的PCR產物...

二代測序——質量控制類問題 如何評估二代測序數據的質量：主要通過一些質量指標來評估,，如Q值（質量值）分布,，用于衡量每個堿基的測序質量；堿基含量分布,，檢查四種堿基的比例是否正常,；GC含量分布，看是否與預期的基因組GC含量相符,；序列重復度,，評估數據中重復...

二代測序——微生物基因組應用領域 環(huán)境領域 環(huán)境微生物監(jiān)測：對土壤、水體等環(huán)境中的微生物群落進行監(jiān)測,。通過二代測序微生物基因組,，可以了解環(huán)境微生物的多樣性和功能。例如,，在監(jiān)測土壤污染修復過程中,，對土壤微生物基因組進行測序，可以發(fā)現能夠降解污染物...

一代,、二代,、三代測序的區(qū)別分別是什么？ 一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,，也稱為Sanger測序,。 二代測序技術(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現的，能夠同時對上百萬甚至數十億個...

一代,、二代,、三代測序的區(qū)別分別是什么？ 一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,，也稱為Sanger測序,。 二代測序技術(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現的，能夠同時對上百萬甚至數十億個...

二代測序——質量控制類問題 如何評估二代測序數據的質量：主要通過一些質量指標來評估,，如Q值（質量值）分布,，用于衡量每個堿基的測序質量；堿基含量分布,，檢查四種堿基的比例是否正常,；GC含量分布,，看是否與預期的基因組GC含量相符；序列重復度,，評估數據中重復...

一代,、二代、三代測序的技術原理和技術特點分別是什么,？ 技術原理： 一代—雙脫氧終止法 二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像 三代—PacBio SMRT測序技術 技術特點： 一代—只能檢測序列一致的PCR產物...

二代測序的建庫步驟⑥ 六,、文庫質量檢測 定量檢測：使用熒光定量PCR（qPCR）或其他核酸定量方法（如Qubit）來確定文庫的濃度。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結合的定量方法,，它可以準確地測量DNA或RNA的濃度，并且對不同大小的核...

二代測序—全外顯子測序的原理是什么,？ 全外顯子測序主要是利用序列捕獲技術,，將基因組 DNA 中的外顯子區(qū)域富集起來，然后通過高通量測序技術（如第二代測序技術 Illumina 測序平臺）對富集后的外顯子 DN**段進行測序,。其大致步驟包括 DNA 提...

二代測序——微生物基因組應用領域 工業(yè)領域 微生物菌株改良：在發(fā)酵工業(yè)中,，通過對工業(yè)微生物（如酵母菌、乳酸菌等）基因組測序,，找到與發(fā)酵性能相關的基因,。例如，通過基因編輯技術改造釀酒酵母基因組中與酒精發(fā)酵效率相關的基因,，提高酒精產量,。同時，也可以...

二代測序——應用領域類問題 二代測序在**研究中的應用有哪些：可用于**的早期篩查,，通過檢測血液中的循環(huán)**DNA,；進行**的診斷分型，確定**的基因突變特征,；評估***效果,，監(jiān)測***過程中腫瘤細胞的基因變化；預測**的預后,，分析與預后相關的基因標...

一代,、二代、三代測序的區(qū)別分別是什么,？ 一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,，也稱為Sanger測序。 二代測序技術(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現的,，能夠同時對上百萬甚至數十億個...

二代測序——實驗流程類問題 二代測序的實驗流程包括哪些步驟：首先是樣本準備,，提取高質量的DNA或RNA，并進行片段化處理,；然后進行文庫構建,，在片段兩端連接特定接頭,；接著進行文庫質量檢測和定量，合格的文庫上機測序,；***對測序得到的原始數據進行生物信息...

轉錄組測序的主要測序對象包括以下幾類（上）： 信使RNA（mRNA） mRNA是編碼蛋白質的轉錄本,，在轉錄組測序中，可通過對mRNA的測序和分析,，了解基因的表達水平,、可變剪接情況以及基因結構變異等，從而揭示基因在特定細胞或組織中的功能和調控機制...

二代測序的建庫步驟② 二,、片段化處理 物理方法：超聲破碎是常用的物理片段化方法,。它通過超聲波的高頻振動將核酸分子打斷成合適大小的片段。例如,，在一些文庫構建中,，將DNA樣本置于超聲破碎儀中，通過調整超聲功率和時間,，可以將DNA片段化到幾百堿基對（...

二代測序——轉錄組測序的背景和基本原理 1,、背景：在基因表達過程中，DNA 轉錄為 RNA,，轉錄后的 RNA 會經過一系列加工,，包括剪接等過程形成成熟的 mRNA，然后進行翻譯產生蛋白質,。轉錄組測序可以讓我們在全基因組范圍內研究基因的表達情況,，相比于...

二代測序——轉錄組測序的背景和基本原理 1、背景：在基因表達過程中,，DNA 轉錄為 RNA,，轉錄后的 RNA 會經過一系列加工，包括剪接等過程形成成熟的 mRNA,，然后進行翻譯產生蛋白質,。轉錄組測序可以讓我們在全基因組范圍內研究基因的表達情況，相比于...

一代,、二代,、三代測序的區(qū)別分別是什么？ 一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測序,，也稱為Sanger測序,。 二代測序技術(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現的，能夠同時對上百萬甚至數十億個...

不同二代測序技術平臺的速度 Illumina 測序平臺：這是目前市場上應用較為***的二代測序平臺之一,，其測序速度較快,。例如 Illumina NovaSeq 系列，一次運行可以在 1-3 天內產生大量的數據,，通量可達數億甚至數十億條讀長,，能夠滿足大...