關(guān)于二代測(cè)序的簡(jiǎn)介:
二代測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測(cè)序技術(shù),,是一種能夠同時(shí)對(duì)數(shù)百萬甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測(cè)序的方法,。與傳統(tǒng)的桑格測(cè)序相比二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性,、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢(shì),。
二代測(cè)序技術(shù)在大幅提高了測(cè)序速度的同時(shí),大幅度的降低了測(cè)序成本,,保持了高準(zhǔn)確性,,以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則需要1周,,但其序列讀長(zhǎng)方面比起一代測(cè)序技術(shù)則要短很多,,大多只100bp-150bp。
二代測(cè)序的過程有哪些?北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序的建庫(kù)步驟⑥
六,、文庫(kù)質(zhì)量檢測(cè)
定量檢測(cè):使用熒光定量PCR(qPCR)或其他核酸定量方法(如Qubit)來確定文庫(kù)的濃度,。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結(jié)合的定量方法,它可以準(zhǔn)確地測(cè)量DNA或RNA的濃度,,并且對(duì)不同大小的核酸片段有較好的定量準(zhǔn)確性,。通過定量檢測(cè),可以了解文庫(kù)的產(chǎn)量,,為后續(xù)的測(cè)序上樣量提供參考,。
片段大小檢測(cè):利用瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀(如Agilent2100Bioanalyzer)來檢測(cè)文庫(kù)片段大小。瓊脂糖凝膠電泳是一種傳統(tǒng)的方法,,通過將文庫(kù)樣品在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,,根據(jù)DNA片段在電場(chǎng)中的遷移速度來判斷片段大小。生物分析儀則可以提供更精確的片段大小分布和濃度信息,,它是基于微流體芯片技術(shù),,能夠快速、準(zhǔn)確地分析文庫(kù)質(zhì)量,。 內(nèi)蒙古二代測(cè)序技術(shù)二代測(cè)序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué),。
二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展①
疾病診斷與***領(lǐng)域 :消化系統(tǒng)**標(biāo)志物檢測(cè):2024 年的**共識(shí)指出,二代測(cè)序(NGS)技術(shù)可同時(shí)檢測(cè)消化系統(tǒng)**中的多種標(biāo)志物,,如錯(cuò)配修復(fù)基因變異,、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)狀態(tài)、**突變負(fù)荷(TMB)等,,為**的精細(xì)***提供了更***,、準(zhǔn)確的信息。例如,,MSI-H 的實(shí)體瘤患者可使用帕博利珠單抗進(jìn)行***,,而 NGS 技術(shù)能更好地檢測(cè) MSI 狀態(tài)及相關(guān)耐藥機(jī)制。
**液體活檢:通過檢測(cè)血液中的循環(huán)** DNA(ctDNA)等標(biāo)志物,,實(shí)現(xiàn)對(duì)**的早期篩查,、診斷和***監(jiān)測(cè)。NGS 技術(shù)能夠更敏感地檢測(cè)到 ctDNA 中的基因突變和變異,,為**的無創(chuàng)診斷提供了有力支持,。
什么樣本可以做二代測(cè)序,?③
細(xì)胞樣本
培養(yǎng)細(xì)胞:包括各種原代培養(yǎng)細(xì)胞和細(xì)胞系,。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中,對(duì)培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序可以了解細(xì)胞的基因特征和功能變化,。例如,,在研究細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路時(shí),對(duì)經(jīng)過特定刺激處理的培養(yǎng)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,以分析基因表達(dá)的上調(diào)或下調(diào)情況,。
脫落細(xì)胞:如痰液中的脫落細(xì)胞,、尿液中的脫落細(xì)胞等。這些細(xì)胞可以用于某些疾病的篩查,。例如,,在肺*篩查中,對(duì)痰液中的脫落細(xì)胞進(jìn)行基因檢測(cè),,通過二代測(cè)序?qū)ふ曳?相關(guān)的基因突變,,作為一種非侵入性的檢測(cè)方法。 denovo測(cè)序是二代測(cè)序嗎,?
二代測(cè)序——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域
1,、基礎(chǔ)生物學(xué)研究:可以用于研究生物的發(fā)育過程。例如,,在胚胎發(fā)育過程中,,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以了解不同階段胚胎細(xì)胞中基因的表達(dá)變化,揭示胚胎發(fā)育的分子機(jī)制,。還可以用于物種進(jìn)化研究,,比較不同物種間轉(zhuǎn)錄組的差異,推斷基因表達(dá)的進(jìn)化模式,。
2,、醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷:在疾病研究方面,用于尋找疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物,。例如,,在**研究中,通過對(duì)比**組織和正常組織的轉(zhuǎn)錄組,,可以發(fā)現(xiàn)一些在**中特異性高表達(dá)或低表達(dá)的基因,,這些基因有望成為**診斷、預(yù)后判斷的標(biāo)志物,。同時(shí),,也可以用于藥物研發(fā),通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序了解藥物作用后細(xì)胞基因表達(dá)的變化,,評(píng)估藥物療效和毒性,。
3、農(nóng)業(yè)和植物學(xué)研究:在作物育種中,,可以研究不同品種作物在抗逆性(如抗旱,、抗寒、抗?。┑确矫娴幕虮磉_(dá)差異,,為培育優(yōu)良品種提供理論依據(jù),。在植物生長(zhǎng)發(fā)育研究中,分析植物在不同生長(zhǎng)環(huán)境和生長(zhǎng)階段的轉(zhuǎn)錄組變化,,了解植物***等因素對(duì)植物生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)制,。 二代測(cè)序可以檢測(cè)基因嗎?江蘇嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序結(jié)果怎么分析,?北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異①
**患者
優(yōu)勢(shì):對(duì)于**患者,,二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性相對(duì)較高,在**的診斷,、***及監(jiān)測(cè)等方面應(yīng)用***,。比如肺*患者,通過檢測(cè)**組織或血液中的基因突變,,可準(zhǔn)確找到如EGFR,、ALK等驅(qū)動(dòng)基因突變,為靶向***提供依據(jù),,其準(zhǔn)確率通常在90%以上,。在軟組織**中,二代測(cè)序能檢測(cè)到**組織的基因信息,,包括突變基因,、基因表達(dá)情況等,幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地診斷病情,,并制定個(gè)性化的***方案,。
局限性:腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性會(huì)影響檢測(cè)準(zhǔn)確性,若樣本中腫瘤細(xì)胞比例低或存在多種類型細(xì)胞,,可能導(dǎo)致部分基因突變漏檢,,影響對(duì)**基因組全貌的評(píng)估。此外,,血液樣本中循環(huán)**DNA含量低且釋放不穩(wěn)定,,也會(huì)使檢測(cè)結(jié)果存在波動(dòng),影響準(zhǔn)確性 北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
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