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北京嘉安健達二代測序原理

來源: 發(fā)布時間:2024-12-24

二代測序不同應(yīng)用場景下的速度有多快,?

病原微生物檢測:一般來說,二代測序用于檢測病原微生物時,,能夠在幾個小時到一天左右出結(jié)果。比如在快速檢測血液中的病原微生物時,,通??梢栽趲讉€小時內(nèi)獲得檢測結(jié)果,相比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法,,時間大幅縮短,,傳統(tǒng)血液培養(yǎng)一般需要幾天到一周的時間 。

全基因組測序:如果是對人類全基因組進行測序,,以目前的技術(shù)水平,,使用二代測序技術(shù)完成一個人的全基因組測序,一般需要 1-2 天左右的時間,。而在十幾年前,,人類全基因組測序計劃***完成時,耗費了大量的時間和精力,,相比之下二代測序技術(shù)的速度提升***,。

轉(zhuǎn)錄組測序:轉(zhuǎn)錄組測序的時間相對較短,一般幾個小時內(nèi)可以完成對大量 RNA 分子的測序和初步數(shù)據(jù)分析,,進而快速了解基因在特定條件下的表達情況8. 二代測序是先打斷DNA,,使其片段化。北京嘉安健達二代測序原理

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④二代測序一般多久出結(jié)果,?

4,、數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜程度

數(shù)據(jù)分析是二代測序的重要環(huán)節(jié)。簡單的分析,,如檢測已知的單核苷酸多態(tài)性(SNP),,可以通過與參考基因組比對后利用一些成熟的軟件快速完成。但如果是進行復(fù)雜的分析,,如尋找新的基因融合事件,、復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異的檢測或者進行從頭組裝(denovoassembly),則需要更復(fù)雜的算法和更多的計算資源,花費的時間可能從數(shù)天到數(shù)周,。例如,,對于常規(guī)的SNP檢測和注釋,數(shù)據(jù)分析可能在1-3天內(nèi)完成,;而對于**樣本中復(fù)雜的基因融合分析,,可能需要3-7天甚至更長時間來確保結(jié)果的準確性。 北京嘉安健達二代測序原理二代測序的優(yōu)勢是低成本,。

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二代測序的操作流程有哪些,?

1.DNA提取與質(zhì)檢

· 純凈、足量,、質(zhì)量好的樣本DNA是檢測成功的基礎(chǔ)(可以來源于血漿,、新鮮組織等)

2.DNA處理→文庫構(gòu)建

· 得到統(tǒng)一長度區(qū)間+有接頭的DNA片段

· 步驟:DNA打斷→末端修復(fù)→片段篩選→加A尾→接頭連接→PCR

3.靶向捕獲

· 特定區(qū)域基因的定向檢測

4.上機測序

· 根據(jù)通量情況選擇測序儀

· 上樣后機器完成

5.數(shù)據(jù)分析

· 初級分析:光強數(shù)據(jù)(不同熒光標記堿基)→序列信息(AGCT)

· 二級分析 多儀器自帶

· 三級分析 vcf文件 可diy

二代測序技術(shù)在不同人群中的準確性有何差異④

***性疾病患者

優(yōu)勢:病原學(xué)二代測序可準確檢測病原體的基因序**定病原體種類和基因型,為***性疾病的診斷和***提供依據(jù),,在檢測罕見病原體,、病毒***等方面具有獨特優(yōu)勢,有助于快速明確診斷,,尤其是對于一些傳統(tǒng)檢測方法難以診斷的***性疾病,,如不明原因的發(fā)熱、肺炎,、腦膜炎等,。

局限性:對于低豐度病原體,可能出現(xiàn)假陽性或假陰性結(jié)果,。樣本質(zhì)量,、測序深度和數(shù)據(jù)分析方法等因素也會影響準確性,若樣本中病原體含量低或雜質(zhì)多,,可能導(dǎo)致檢測失敗或結(jié)果不準確 二代測序常用于醫(yī)學(xué)篩查或診斷,。

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什么樣本可以做二代測序?①

1,、血液樣本

全血:這是最常見的樣本類型之一,。血液中含有白細胞,其細胞核內(nèi)有完整的基因組DNA,。通過提取白細胞中的DNA,,可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等,。例如,,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,,提取DNA后,,對與疾病相關(guān)的基因或整個外顯子組進行測序,,以尋找致病突變。

血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA),。在**患者中,,腫瘤細胞會釋放其DNA片段進入血液循環(huán),這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA),。通過對血漿中的ctDNA進行測序,,可以實現(xiàn)**的早期篩查、***過程中的動態(tài)監(jiān)測等,。例如,,對于肺*患者,檢測血漿中的ctDNA來追蹤**的基因突變情況,,為靶向***提供依據(jù),。 二代測序是2005年以后開始的嗎?什么是二代測序流程

單細胞測序也是二代測序,。北京嘉安健達二代測序原理

二代測序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些,?

基因組學(xué)研究:用于全基因組測序,快速獲取物種的基因組序列信息,,研究基因組結(jié)構(gòu)、變異,、進化等,;進行全外顯子組測序,重點關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變,。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:通過對轉(zhuǎn)錄組進行測序,可分析基因的表達水平,、可變剪接,、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等,有助于深入了解基因在不同生理和病理狀態(tài)下的表達調(diào)控機制,。

疾病診斷與***:在遺傳病診斷中,,能夠檢測出導(dǎo)致遺傳病的基因突變,為疾病的診斷,、遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷提供依據(jù),;在**研究中,可分析腫瘤細胞的基因突變,、拷貝數(shù)變異,、基因融合等,為**的早期診斷,、靶向***和預(yù)后評估提供支持,。

藥物研發(fā):用于藥物靶點的發(fā)現(xiàn)和驗證,通過分析疾病相關(guān)的基因變異和表達變化,確定潛在的藥物作用靶點,;還可進行藥物基因組學(xué)研究,,預(yù)測患者對藥物的反應(yīng)和不良反應(yīng),實現(xiàn)個體化藥物***,。

微生物學(xué)研究:對微生物群落進行宏基因組測序,,無需培養(yǎng)即可分析微生物的種類、豐度和功能基因,,了解微生物群落的結(jié)構(gòu)和動態(tài)變化,,研究微生物與宿主的相互作用,以及在環(huán)境科學(xué),、農(nóng)業(yè),、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用


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標簽: 二代測序