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濟(jì)南常規(guī)靶向代謝組學(xué)研究方法

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-16

代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,,對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系的研究方式,,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分,。其研究對(duì)象大都是相對(duì)分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和**系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法,。 代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門(mén)學(xué)科,,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分?;蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從基因和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動(dòng),,而實(shí)際上細(xì)胞內(nèi)許多生命活動(dòng)是發(fā)生在代謝物層面的,如細(xì)胞信號(hào)釋放(cell signaling),,能量傳遞,,細(xì)胞間通信等都是受代謝物調(diào)控的。代謝組學(xué)正是研究代謝組(metabolome)——在某一時(shí)刻細(xì)胞內(nèi)所有代謝物的組合——的一門(mén)學(xué)科,。代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些,?濟(jì)南常規(guī)靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性,、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn),。盡管充滿了挑戰(zhàn),,研究人員仍然堅(jiān)信,,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密,。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過(guò)程變化,,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過(guò)對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法,。浙江農(nóng)學(xué)靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究,。

代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn)?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實(shí)情況,,因此,在多數(shù)生物表型研究上更加適用,。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測(cè)定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病,、毒性,、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物,。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷,、藥物篩選或者其他分型評(píng)估等潛在生物標(biāo)志物。謝組學(xué)通過(guò)揭示內(nèi)在和外在因素影響下,,生物體的代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過(guò)程,。

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談,,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),,有以下幾個(gè)方面需要注意,。1)前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同,。因此,,一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備,,以減少人為的誤差,。2)檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài),。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),,推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控,。在每一個(gè)項(xiàng)目開(kāi)始之前,先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè),,確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng),。3)后期數(shù)據(jù)矯正,,特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目,。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個(gè)樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時(shí),,使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對(duì)整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正,。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,。

代謝組學(xué)發(fā)展至今,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了標(biāo)準(zhǔn)臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物,。代謝組學(xué)提供了代謝表型的詳細(xì)表征,并可以在許多水平上進(jìn)行精密醫(yī)學(xué)研究,,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標(biāo)以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測(cè)藥物的活性,。比較常見(jiàn)的代謝組學(xué)分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為L(zhǎng)C-MS和GC-MS,。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,,經(jīng)加速電場(chǎng)的作用,形成離子束,,進(jìn)入質(zhì)量分析器。代謝組學(xué)研究對(duì)象大都是相對(duì)分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),。濟(jì)南脂質(zhì)代謝組學(xué)多研究方法

代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。濟(jì)南常規(guī)靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000),。 在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域,。其樣品主要是動(dòng)植物的細(xì)胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR),,質(zhì)譜(MS),色譜(HPLC,,GC),其中以NMR為主,。通過(guò)檢測(cè)一系列樣品的NMR 譜圖,再結(jié)合模式識(shí)別方法,,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker),。濟(jì)南常規(guī)靶向代謝組學(xué)研究方法

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