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蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義?在哺乳動(dòng)物細(xì)胞生命周期中,,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過(guò)磷酸化修飾,,在脊椎動(dòng)物基因中,,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過(guò)程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過(guò)激發(fā),、調(diào)節(jié)諸多信號(hào)通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長(zhǎng),、發(fā)育、逆境應(yīng)激,、疾病發(fā)生等多種生命過(guò)程,,一直是生物學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(tuán)(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類(lèi)的氨基酸上(主要包括絲氨酸S,、蘇氨酸T,、酪氨酸Y),從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過(guò)程,。蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過(guò)共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過(guò)程,。廣州棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有:a. 凝集素親和技術(shù),;b. 肼化學(xué)富集,;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng),?;谫|(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點(diǎn)測(cè)定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法,;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法,。泛素化:泛素是一種由76個(gè)氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,,可通過(guò)異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴(lài)氨酸殘基的氨基進(jìn)行共價(jià)連接,。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進(jìn)行標(biāo)記,,并通過(guò)鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白,。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,,使肽的質(zhì)量增加114,,因此可作為泛素定位位點(diǎn)的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)分離,,使用針對(duì)特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點(diǎn),。河南乙?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,。
翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學(xué)水平上對(duì)存在翻譯后修飾的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,。翻譯后修飾蛋白組是指細(xì)胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過(guò)程,。蛋白翻譯后修飾通過(guò)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基上加修飾基團(tuán)或通過(guò)蛋白質(zhì)水解去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的功能。經(jīng)過(guò)翻譯后修飾的蛋白質(zhì)稱(chēng)為翻譯后修飾蛋白,。目前,,已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化,、乙?;⒎核鼗?、二硫鍵配對(duì),、甲基化和亞硝基化等等。
蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩?duì)乙?;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?duì)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對(duì)代謝通路的調(diào)控這兩個(gè)方面,。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了,。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,,從而對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,因此,,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán),。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性,。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙?;?。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性。
蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)技術(shù):乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用,。此外,,還存在的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié),。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?;b定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過(guò)抗體富集乙?;碾亩?,從而實(shí)現(xiàn)乙酰化的鑒定及定量,。樣品要求:1,、SDS-PAGE條帶:5個(gè)以上可見(jiàn)考染條帶。2,、溶液(目標(biāo)蛋白質(zhì)):目標(biāo)蛋白總量>50μg,,目標(biāo)蛋白濃度>80%。3,、溶液(大規(guī)?;旌系鞍踪|(zhì)):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl,。蛋白質(zhì)糖基化是一種常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,。廣州棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性,、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化,。廣州棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過(guò)程的重要方式,,幾乎在每個(gè)細(xì)胞過(guò)程中都是不可或缺的,。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在,,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對(duì)其的檢測(cè),。因此,要在蛋白質(zhì)組學(xué)的范圍內(nèi)表征翻譯后修飾蛋白,,純化方法是必要的,,以分離修飾蛋白和肽段,,然后再進(jìn)行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行,,可以對(duì)翻譯后修飾蛋白組進(jìn)行定性和定量研究,。廣州棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
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