定量蛋白質(zhì)組學方法學介紹:Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質(zhì)組學,,不需要對比較樣本做特定標記處理,,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),。Label-free定量不需要標記處理,,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,,但對實驗操作的穩(wěn)定性,、重復性要求較高,準確性也較標記定量差,。因此,,Label-free技術適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標記定量實現(xiàn)的實驗設計,。對人類而言,,蛋白質(zhì)組學的研究終究要服務于人類的健康。TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學價格
非標定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度,,分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化,,認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關,因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,,通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量,。按照其原理主要分為兩種,第1種spectrumcounts類的非標記方法,,發(fā)展比較早,,已經(jīng)形成多種定量算法,但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎,,各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正,。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎,計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分,。TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學價格蛋白質(zhì)組學技術并帶領生物技術取得關鍵性的突破,。
蛋白質(zhì)組學樣品寄樣要求:動物組織的樣本蛋白量相對較高,送樣量的要求也相對比較寬松,一般提供50~100mg的量即可,。此外,,組織上有血跡、脂肪,、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈,。送樣前將樣品用液氮速凍5min,放置在-80℃保存,,送樣時需要置于干冰環(huán)境中運輸,。動物的懸浮培養(yǎng)細胞也是比較熱門的蛋白組學研究對象,如果想做細胞的蛋白組學,,起碼需要1×107個細胞,,離心后收集,置于-80攝氏度環(huán)境中,。蛋白質(zhì)組學,,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模,、系統(tǒng)化地研究,,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術):應用:1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合,。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數(shù)據(jù),。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白,。技術特點:1.對質(zhì)譜儀器設備要求較高,,色譜和質(zhì)譜需要同時有較好的穩(wěn)定性和重復性。2.需要有特殊的定量分析軟件,。3.對樣品中蛋白質(zhì)總量要求較低,,實驗周期短,實驗費用低,。4.不需要額外并且昂貴的標記試劑,,排除了標記過程帶入實驗誤差的風險,同時也不必考慮標記效率的問題,。DIA 定量蛋白質(zhì)組學的循環(huán)時間固定,,掃描點數(shù)均勻,定量準確度高,。
蛋白質(zhì)組學我的介紹:蛋白質(zhì)組學(proteomics)采用高通量和大規(guī)模的研究手段,,從整體的角度分析細胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達水平與修飾狀態(tài),,了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,,揭示蛋白質(zhì)功能與細胞生命活動規(guī)律,之后達到構(gòu)建出細胞的“功能圖”的目的。蛋白質(zhì)作為生命活動的物質(zhì)承擔者,、生理功能的執(zhí)行者和生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,,研究蛋白質(zhì)對闡明生命體的變化機制具有重要作用。蛋白質(zhì)組研究不只可以實現(xiàn)與基因組的關聯(lián),,揭示生命活動的發(fā)生規(guī)律,。同樣對人類重大疾病的發(fā)生與發(fā)展的病理機制研究也具有重要作用。生命體的生理,、病理過程,,藥物和環(huán)境因子的作用都依賴于蛋白質(zhì),并引起蛋白質(zhì)的變化,。蛋白質(zhì)組學研究對提高我國生物醫(yī)學原始創(chuàng)新能力,、重大疾病防診治能力和國民健康水平以及新藥研發(fā)能力、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義,。蛋白質(zhì)組學技術有電噴霧質(zhì)譜,。北京外泌體蛋白質(zhì)組學主要技術
DIA 定量蛋白質(zhì)組學可以采集所有離子及碎片圖譜,重現(xiàn)性好,。TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學價格
定量蛋白質(zhì)組學分析(QuantitativeProteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量,。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,,結(jié)合生物信息學揭示細胞生理病理等功能,,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學技術常見標記(Label)和非標記的(LabelFree)定量策略,。定量蛋白質(zhì)組學技術常見的幾類主要包括:LabelFree定量蛋白組分析,、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析,、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析,、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析,。TMT/iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學價格