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深圳蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析研究

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-16

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過(guò)程的重要方式,,幾乎在每個(gè)細(xì)胞過(guò)程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義,。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在,,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對(duì)其的檢測(cè)。蛋白質(zhì)是各種細(xì)胞功能比較重要的執(zhí)行者,,其功能正常與否決定著生命活動(dòng)能否有序,、高效的進(jìn)行,而其中翻譯后修飾起著至關(guān)重要的作用,。翻譯后修飾改變了蛋白質(zhì)中不同氨基酸殘基上的生物化學(xué)官能團(tuán),,進(jìn)而改變其化學(xué)性質(zhì)或結(jié)構(gòu),使得蛋白質(zhì)具有更為復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和更為完善的功能,,實(shí)現(xiàn)更為精細(xì)的調(diào)節(jié),。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾過(guò)程極其復(fù)雜,已知的翻譯后修飾種類(lèi)有20多種。但其中較為常見(jiàn)的主要是磷酸化,、泛素化、SUMO化,、酰(含乙酰)化,、甲基化以及糖基化。通過(guò)蛋白質(zhì)翻譯后修飾也進(jìn)一步增加了細(xì)胞通路機(jī)制和生命活動(dòng)的多樣性和復(fù)雜性,。深圳蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過(guò)程。它通過(guò)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基加上修飾基團(tuán),,可以改變蛋白質(zhì)的物理,、化學(xué)性質(zhì),進(jìn)而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài),、亞細(xì)胞定位,、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動(dòng)研究中具有重大意義,,異常的翻譯后修飾會(huì)導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生,。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對(duì)翻譯后修飾方式進(jìn)行鑒定和定量,。北京泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式,。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)介紹: 蛋白質(zhì)泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是指一個(gè)或多個(gè)泛素分子(Ubiquitin,,由76個(gè)氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,,將細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)分類(lèi),從中選出靶蛋白分子,,并對(duì)靶蛋白進(jìn)行特異性修飾的過(guò)程,。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物80%~85%的蛋白質(zhì)降解,。除參與蛋白質(zhì)降解之外,,泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖,、細(xì)胞凋亡,、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控,、基因表達(dá),、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞,、損傷修復(fù),、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)怎么確定位點(diǎn)?蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈,。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da。之后用高精度LC-MS質(zhì)譜儀檢測(cè)脫糖后的肽段,,并通過(guò)MASCOT軟件檢索數(shù)據(jù)庫(kù),,確認(rèn)脫糖后分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,從而確定該蛋白質(zhì)的N-糖基化位點(diǎn),。琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點(diǎn):采用主流抗體親和富集方法,特異性高,,富集效率好,。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)是什么?

泛素化修飾PRM定量驗(yàn)證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解,。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,,調(diào)控包括細(xì)胞周期,、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控,、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng),。首先對(duì)泛素化的蛋白進(jìn)行胰酶消化,在賴(lài)氨酸的修飾位點(diǎn)上會(huì)產(chǎn)生兩個(gè)甘氨酸的殘基(K-GG),,利用對(duì)泛素化賴(lài)氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,,特異性富集復(fù)雜樣本中的泛素化肽段,結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,,實(shí)現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析,。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用。南京蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)質(zhì)譜鑒定

蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進(jìn)一步促進(jìn)了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加,。深圳蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細(xì)胞生長(zhǎng)的不同時(shí)期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化,。然而,,許多生命過(guò)程不僅受蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度控制,還受時(shí)空分布可逆的翻譯后修飾控制,。因此,,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,。目前,,發(fā)現(xiàn)的比較常見(jiàn)的修飾類(lèi)型是糖基化,、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低,、動(dòng)態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來(lái)了很大的挑戰(zhàn),。基于翻譯后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對(duì)豐度低的特點(diǎn),,主要利用凝膠,、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對(duì)其進(jìn)行研究。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類(lèi)似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析,。深圳蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析研究