磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：在有機(jī)體內(nèi),，磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價(jià)修飾形式,，同時(shí)也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對(duì)蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用,，該過(guò)程是由蛋白質(zhì)激酶（Kinase）催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底物蛋白質(zhì)的氨基酸殘基,，如絲氨酸（Serine,，Ser，S）,、蘇氨酸（Threonine,，Thr，T）和酪氨酸（Tyrosine,，Tyr,，Y）等上的過(guò)程，而其逆向過(guò)程則是由蛋白質(zhì)磷酸酶去除相應(yīng)的磷酸基團(tuán),。正是這兩種酶的相反作用及其中所涉及到的能量消耗與生成使磷酸化成為體內(nèi)很多生理活動(dòng)調(diào)控的首先選擇方式,。蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。廣州蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)類型

蛋白質(zhì)翻譯后修飾自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析,。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,，用GluC進(jìn)行消化,。然后用弱陽(yáng)離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用，對(duì)樣品進(jìn)行理想的分離,。譜識(shí)別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行,，但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的問(wèn)題，需要對(duì)結(jié)果進(jìn)行過(guò)濾,。自上而下分析策略：自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對(duì)其進(jìn)行片段化,，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前,，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線,。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC,。湖北磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸,、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化。

蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)怎么確定位點(diǎn),？蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段,，然后用N-糖酰胺酶（PNGase）在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基（Asn）上的糖鏈。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da,。之后用高精度LC-MS質(zhì)譜儀檢測(cè)脫糖后的肽段,，并通過(guò)MASCOT軟件檢索數(shù)據(jù)庫(kù)，確認(rèn)脫糖后分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,，從而確定該蛋白質(zhì)的N-糖基化位點(diǎn),。琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)特點(diǎn)：采用主流抗體親和富集方法,，特異性高,，富集效率好。

泛素化修飾蛋白組學(xué)研究：泛素化修飾蛋白組學(xué)是一種重要的翻譯后修飾,。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,，調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡,、轉(zhuǎn)錄調(diào)控,、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng),。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣,，質(zhì)譜分析前需要對(duì)修飾進(jìn)行富集以提高其豐度,，然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對(duì)富集得到的泛素化肽段樣品進(jìn)行定量分析。蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過(guò)共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過(guò)程,。

糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)的糖基化具有異質(zhì)性,。不同的糖鏈可以連接到同一位點(diǎn)上，不同位點(diǎn)可以連接到同一蛋白質(zhì)上的不同糖鏈上,。糖基化的異質(zhì)性嚴(yán)重阻礙了糖蛋白的分離和分析,。不同糖類型的相同蛋白質(zhì)，在電泳上會(huì)出現(xiàn)分散的條帶,，導(dǎo)致信號(hào)分散,。此外，對(duì)低豐度蛋白質(zhì)的識(shí)別性差導(dǎo)致糖蛋白在色譜圖中分離不佳,，質(zhì)譜中有一簇分子量不準(zhǔn)確的分辨不清的峰,。目前，蛋白糖基化研究的主要策略是利用現(xiàn)有的技術(shù)體系對(duì)糖基化蛋白的糖基化肽段進(jìn)行分離和富集,，消除糖基化的異質(zhì)性及其對(duì)質(zhì)譜的影響,，標(biāo)記糖基化位點(diǎn)。從而實(shí)現(xiàn)高通量糖蛋白和糖基化位點(diǎn)的識(shí)別,。常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有：a. 凝集素親和技術(shù),；b. 肼化學(xué)富集；c. 親水性相互作用色譜法,；d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng),。基于質(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點(diǎn)測(cè)定方法有：a. PNGase F酶法,；b. Endo H酶法,；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有有效性,。廣東蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有靈活的特性,。廣州蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)類型

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)是什么？蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過(guò)程,，即通過(guò)1個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基加上修飾基團(tuán)或通過(guò)蛋白質(zhì)水解剪去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),。蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications，PTMs),，相較于沒(méi)有發(fā)生修飾的蛋白,，PTMs會(huì)導(dǎo)致特定序列分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過(guò)程中,，蛋白會(huì)首先被酶切成肽段,，然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析,；通過(guò)質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息,。對(duì)于某一個(gè)特定肽段而言,，在沒(méi)有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下，其序列信息和分子量是確定的,。廣州蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)類型