轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理?xiàng)l件下細(xì)胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合，表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài),。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以對(duì)所有轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行分類、確定基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu),、量化轉(zhuǎn)錄物的表達(dá)水平。蛋白質(zhì)是生命功能的直接執(zhí)行者,，蛋白組是一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì),。整合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的表達(dá)數(shù)據(jù)對(duì)生物樣本進(jìn)行研究，可以從整體上解釋生物學(xué)問(wèn)題,，探究生物體生理和疾病機(jī)理等,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤發(fā)生機(jī)制研究：利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)可檢測(cè)瘤細(xì)胞惡化過(guò)程中的RNA（編碼RNA及非編碼RNA）的變化，有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機(jī)制,。相對(duì)于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺(tái),，轉(zhuǎn)錄學(xué)組測(cè)序無(wú)需預(yù)先針對(duì)已知序列設(shè)計(jì)探針,。上海外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制研究：circRNA是一種非編碼RNA,，可以多種方式參與生物學(xué)功能，如細(xì)胞增殖,、細(xì)胞周期,、侵襲和轉(zhuǎn)移等。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),，環(huán)狀RNA可以通過(guò)海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,，從而影響瘤耐藥過(guò)程中的DNA修復(fù)、凋亡,、增殖,、細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)，以及介導(dǎo)瘤耐藥的細(xì)胞內(nèi)酶,，進(jìn)而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：農(nóng)林領(lǐng)域：生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制，抗逆脅迫機(jī)制,，育種,，物種保護(hù)研究等；畜牧業(yè)：生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,，致病機(jī)理研究,，肉類及乳制品品質(zhì)研究等。貴陽(yáng)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)轉(zhuǎn)錄組廣義上指在某一生理?xiàng)l件下,，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合,。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)試步驟：第1步就是把單個(gè)細(xì)胞分選出來(lái)。分選的方式也比較多,，物理切割,，酶消化,，F(xiàn)ACS分選等。假如已經(jīng)分到了一個(gè)單細(xì)胞,，跟常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組步驟上是一樣的,。下一步就是把單細(xì)胞里的RNA提取出來(lái)去建庫(kù)測(cè)序。但是一個(gè)細(xì)胞里的RNA含量是比較少的,，難建庫(kù)成功,。這個(gè)里面“量”的概念很有意思。比如說(shuō)單細(xì)胞量少,，需要特殊處理,。因?yàn)閱渭?xì)胞里面RNA的量少，所以說(shuō)整個(gè)富集的過(guò)程中會(huì)出現(xiàn)一部分基因在一個(gè)細(xì)胞里能檢測(cè)到,，在另外一個(gè)細(xì)胞里面檢測(cè)不到,，而每個(gè)細(xì)胞里面的檢測(cè)存在一個(gè)隨機(jī)性，同時(shí)單細(xì)胞測(cè)序深度比較低,，所以說(shuō)分析時(shí)相比于普通轉(zhuǎn)錄組有一些是需要特別注意,，但整體的分析思路是類似的。

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)：是一類具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子,，沒(méi)有5′帽子結(jié)構(gòu)和3′poly（A）結(jié)構(gòu),，主要位于細(xì)胞質(zhì)或儲(chǔ)存于外泌體中，不受RNA外切酶影響,，表達(dá)更穩(wěn)定且不易降解,，已被證明普遍存在于多種真核生物體內(nèi)[1]。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而成,，也有部分circRNA是由內(nèi)含子環(huán)化而成的套索結(jié)構(gòu),。同時(shí)由于circRNA含有大量的miRNA應(yīng)答原件（MREs），能與AGO蛋白形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體（RISC）的催化關(guān)鍵,，然后導(dǎo)致circRNA降解,。根據(jù)來(lái)源，circRNA可大致分為四類：全外顯子型的circRNA,，內(nèi)含子和外顯子組合的EIcircRNA,，內(nèi)含子組成的套索型ciRNA，由病毒RNA基因組,、tRNA,、rRNA、snRNA等環(huán)化產(chǎn)生的circRNA,。circRNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)或外泌體中,，具有組織特異性、疾病特異性、時(shí)序特異性及高穩(wěn)定性等特征,。

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì)：相比基因芯片和標(biāo)記的堿基序列的測(cè)序方法,，RNA-seq具有一定的優(yōu)越性。與基因芯片相比,，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來(lái)測(cè)量基因的表達(dá)水平情況,，還可以揭示未知的轉(zhuǎn)錄組和拼接亞型，并為選擇性拼接亞型提供定量分析,。轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics),，是一門(mén)在真整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科，從RNA水平研究基因的表達(dá)情況,。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是通過(guò)二代測(cè)序平臺(tái)快速全方面地獲得某一物種特定細(xì)胞或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有的轉(zhuǎn)錄本及基因序列,，可以用來(lái)研究基因表達(dá)量、基因功能,、結(jié)構(gòu),、可變剪接和預(yù)測(cè)新的轉(zhuǎn)錄本等等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)廣義上指在某一生理?xiàng)l件下,，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合,。貴陽(yáng)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)服務(wù)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量、更精確的數(shù)字信號(hào),。上海外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定

RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì)有：1,、可以直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度;2,、靈敏度高，可以檢測(cè)細(xì)胞中少至幾個(gè)拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;3,、可以對(duì)任意物種進(jìn)行全基因組分析,，能夠檢測(cè)未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,，并準(zhǔn)確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,，UTR區(qū)域;4、檢測(cè)范圍廣,，能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本,。RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)是需要生物學(xué)重復(fù)的，至少需要兩次生物學(xué)重復(fù),，3次以上的生物學(xué)重復(fù)更好,。以3個(gè)重復(fù)為例，加上對(duì)照的三個(gè)生物學(xué)重復(fù),，一次RNA-seq需要6個(gè)樣本,。上海外泌體轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定