定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義：從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞,、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達量的研究,。對處不同時期、不同條件下蛋白質(zhì)表達水平變化的研究，識別功能模塊和路徑,，監(jiān)控疾病的生物標志物,，這些研究都需要對蛋白質(zhì)進行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達分析提供了更可靠,、動態(tài)范圍更廣的研究手段,。基于質(zhì)譜技術(shù),，科學(xué)家們不斷開發(fā)出新的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,，來了解細胞、組織或生物體的整體蛋白質(zhì)動力學(xué),。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞分化,、蛋白質(zhì)折疊等,。南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)有什么用，能給我實驗帶來什么,？可以大規(guī)模鑒定特定組織,、細胞等各種樣本的蛋白質(zhì)種類、修飾狀態(tài)以及蛋白質(zhì)之間的相互作用,，以及對這些蛋白質(zhì)功能分析,、分類；可以對不同條件下某一特定樣本進行大規(guī)模的蛋白質(zhì)(包括翻譯后修飾蛋白)表達量變化分析,，篩選潛在biomarker,，篩選重要信號通路；依托大樣本量,，可以實現(xiàn)疾病的分子分型分析,、重要潛在靶標鑒定。質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)和芯片哪個更好出結(jié)果,？若有對應(yīng)物種的全基因組并有預(yù)測的全蛋白序列庫,，可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫；若無全蛋白序列庫,，有對應(yīng)物種對應(yīng)組織的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果并,，可以使用轉(zhuǎn)錄組的測序結(jié)果（mRNA三框翻譯或者預(yù)測CDS，并翻譯成氨基酸序列）,；若基因組,、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫都沒有，優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫,，若近源物種沒有合適的全蛋白庫,，則選擇更大的蛋白全庫（如動物全庫,、綠色植物全庫、微生物庫等）,。貴州蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來看）,，就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。

蛋白組學(xué)常見研究模式主要有兩種：1.通過蛋白質(zhì)組學(xué)尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標志物,；2.結(jié)合其它組學(xué)建立疾病或者研究主題的表達譜和分子機制,。蛋白質(zhì)組學(xué)( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)，包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,，蛋白質(zhì)的豐度,，蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用,。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性,，表示某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的，然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別,。

蛋白質(zhì)組學(xué)常用技術(shù)：非靶向蛋白組學(xué)：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定）,，高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量）,，多肽組學(xué),。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對象上，覆蓋了原核微生物,、真核微生物,、植物和動物等范圍。蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織,、細胞）,、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象,，通過對蛋白組進行定性,、定量、分子功能分析,、通路互作分析和蛋白互作分析,，揭示生物學(xué)功能、作用機制,、疾病診斷的標志物以及預(yù)測蛋白的上,、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測的不確定性,、反映核酸翻譯后修飾情況,。蛋白質(zhì)組可以隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變,。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：產(chǎn)品分類：a.相對定量(目的同WB),。b.一定定量(目的同Elisa),。技術(shù)優(yōu)勢：（1）無需抗體，可直接對樣本中目標蛋白質(zhì)進行定量分析,。（2）高特異性,、準確度和靈敏度，靶向檢測目標蛋白對應(yīng)的多個unique肽段,。（3）通量高,，可以同時實現(xiàn)幾十個蛋白的定量檢測。樣本要求：動物及臨床組織標本100mg/sample,，血清,、血漿200μL/sample，細胞,、微生物1×107cells/sample,。應(yīng)用方向：驗證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果；目標蛋白相對定量和一定定量分析,。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時代的科學(xué)研究,，針對基因表達產(chǎn)物進行檢測與定量。蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的,？南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略有什么,？南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)組一詞，源于蛋白質(zhì)與基因組兩個詞的組合,，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質(zhì)”,，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,，包括蛋白質(zhì)的表達水平,，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等,，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,，細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。蛋白質(zhì)組的研究不只能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑,。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,，它們可成為新藥物設(shè)計的分子靶點,，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,，那些世界范圍內(nèi)銷路*的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子,。因此，蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,。南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域